监视居住期间案件移交检察院后，是否起诉要依据具体案件情况判断。有可能起诉，也有可能不起诉。

监视居住是一种刑事强制措施，当案件从侦查阶段移送到检察院时，检察院会对案件进行全面审查，以决定是否向法院提起公诉。

可能起诉的情况：如果检察院经过审查，认为犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，就会作出起诉决定。例如在一些盗窃案件中，有监控视频清晰记录了犯罪嫌疑人的盗窃行为，现场也提取到了嫌疑人的指纹等关键证据，并且嫌疑人对犯罪事实供认不讳，这种情况下，即便嫌疑人处于监视居住期间，检察院大概率会提起公诉。因为法律规定，凡是需要提起公诉的案件，一律由人民检察院审查决定，而符合起诉条件的案件，检察院有职责将犯罪嫌疑人交付审判，以维护社会的公平正义和法律的尊严。

可能不起诉的情况：存在多种情形可能导致检察院作出不起诉决定。一是法定不起诉，比如犯罪嫌疑人的行为情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪；犯罪已过追诉时效期限；经特赦令免除刑罚等。例如一些邻里纠纷引发的轻微伤害案件，经过调解，双方达成和解，且伤害后果轻微，这种情况下就可能符合法定不起诉条件。二是酌定不起诉，对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，检察院可以作出不起诉决定。三是证据不足不起诉，如果检察院认为证据不足，不符合起诉条件，经过补充侦查后，仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。

综上所述，监视居住期间案件移交检察院后，最终是否起诉要根据案件的具体事实、证据以及法律规定等多方面因素综合判断。

法律依据：

《中华人民共和国刑事诉讼法》 第七十七条

被监视居住的犯罪嫌疑人、被告人应当遵守以下规定：

（一）未经执行机关批准不得离开执行监视居住的处所；

（二）未经执行机关批准不得会见他人或者通信；

（三）在传讯的时候及时到案；

（四）不得以任何形式干扰证人作证；

（五）不得毁灭、伪造证据或者串供；

（六）将护照等出入境证件、身份证件、驾驶证件交执行机关保存。

被监视居住的犯罪嫌疑人、被告人违反前款规定，情节严重的，可以予以逮捕；需要予以逮捕的，可以对犯罪嫌疑人、被告人先行拘留。