醉驾案件中缴纳的1000元保证金为取保候审保证金，核心作用是保证犯罪嫌疑人遵守取保候审期间的法定义务。办理流程包括：缴纳后严格遵守相关规定；案件终结（如侦查终结、不起诉或判决生效）后向决定取保候审的机关提交退还申请；经审核符合条件的，由银行将保证金退还至原账户。若违反义务，保证金可能被依法没收。

醉驾案件中涉及的1000元保证金，在法律上称为“取保候审保证金”，其办理需严格遵循刑事诉讼程序及相关法律规定。以下从保证金性质、义务遵守、退还流程等方面展开说明：

一、保证金的法律性质与作用

根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第七十二条，取保候审保证金是司法机关责令犯罪嫌疑人缴纳的金钱担保，目的是约束其在取保候审期间不逃避侦查、起诉和审判，并随传随到。该制度既保障刑事诉讼活动顺利进行，也体现对犯罪嫌疑人基本权利的保障。根据《公安机关办理刑事案件程序规定》第八十七条，保证金数额需综合犯罪嫌疑人社会危险性、案件情节等因素确定，最低不低于1000元，因此1000元保证金符合法定最低标准。

二、缴纳后的核心注意事项：严格遵守法定义务

缴纳保证金后，犯罪嫌疑人在取保候审期间必须严格遵守《刑事诉讼法》第七十一条规定的义务，否则可能导致保证金被没收。具体包括：未经执行机关批准不得离开所居住的市、县；住址、工作单位和联系方式发生变动的，需在二十四小时内向执行机关报告；在传讯时及时到案；不得以任何形式干扰证人作证；不得毁灭、伪造证据或串供。执行机关（通常为公安机关）会书面告知上述义务，犯罪嫌疑人需签字确认并严格履行。

三、案件终结后需主动申请退还保证金

当醉驾案件进入侦查终结、检察院作出不起诉决定或法院判决生效后，取保候审措施自动解除，此时需主动办理保证金退还手续，具体流程如下：

1. 确定申请机关：向最初决定取保候审的机关提交申请。若取保候审由公安机关决定，向公安机关申请；由检察院或法院决定的，分别向检察院或法院申请。

2. 提交申请材料：需提供书面退还保证金申请书（注明申请人基本信息、保证金缴纳时间、金额、案件处理结果等）、保证金缴纳凭证（如银行收款收据、缴费回执）、本人身份证明（身份证复印件）及案件终结法律文书（如不起诉决定书、判决书复印件）。

3. 审核与退还：相关机关收到申请后，会在3个工作日内审核是否存在违反取保候审义务的情形。审核通过的，将签发《退还保证金决定书》，并通知保证金缴纳银行将款项退还至原缴纳账户。根据《最高人民法院、最高人民检察院、公安部、国家安全部关于取保候审若干问题的规定》第二十一条，退还保证金的决定需在7日内执行完毕。

四、保证金可能被没收的法定情形

若犯罪嫌疑人在取保候审期间违反法定义务，相关机关可依法没收部分或全部保证金。根据《公安机关办理刑事案件程序规定》第九十六条，常见情形包括：未经批准离开所居住的市、县；传讯时未及时到案；干扰证人作证；毁灭、伪造证据或串供等。没收保证金需经县级以上公安机关负责人批准，并书面通知犯罪嫌疑人。没收后，根据案件情况，可能责令犯罪嫌疑人重新缴纳保证金或变更强制措施（如逮捕）。

五、特殊问题处理：凭证丢失或跨机关办理

若保证金缴纳凭证丢失，可向原缴纳银行申请调取交易记录，或向决定取保候审的机关申请出具缴纳证明。若案件由多个机关办理（如公安机关侦查后移送检察院起诉），保证金退还申请仍向最初决定机关提出，无需重复向后续机关申请。此外，保证金退还不受案件处理结果影响（如判决有罪仍可退还），仅与是否遵守取保候审义务挂钩。

法律依据：

《中华人民共和国刑事诉讼法》 第七十二条

取保候审的决定机关应当综合考虑保证诉讼活动正常进行的需要，被取保候审人的社会危险性，案件的性质、情节，可能判处刑罚的轻重，被取保候审人的经济状况等情况，确定保证金的数额。

提供保证金的人应当将保证金存入执行机关指定银行的专门账户。

《中华人民共和国刑事诉讼法》 第七十三条

犯罪嫌疑人、被告人在取保候审期间未违反本法第七十一条规定的，取保候审结束的时候，凭解除取保候审的通知或者有关法律文书到银行领取退还的保证金。