认定恶意串通合同无效需从主观和客观两方面判断。主观上要求当事人存在恶意通谋的故意，客观上该行为损害了国家、集体或者第三人利益，同时要结合相关证据和法律规定综合认定。

在法律实践中，恶意串通合同无效的认定是一个复杂且严谨的过程。首先从主观方面来看，当事人需有恶意通谋的故意。恶意是指当事人明知或应知其行为会损害国家、集体或者第三人的利益，却仍然积极追求该结果的发生。串通则强调当事人之间存在意思联络，他们相互配合、共同实施损害他人利益的行为。例如，在一些商业交易中，卖方与买方私下达成协议，故意抬高交易价格，目的是套取国家补贴资金，这种行为就体现了双方的恶意串通故意。

从客观方面来说，该行为必须损害了国家、集体或者第三人的利益。损害国家利益通常表现为合同行为违反了国家的宏观经济政策、税收政策等，导致国家财产的损失。损害集体利益可能涉及对集体企业、农村集体组织等的权益侵害。而损害第三人利益，可能是合同当事人通过合同安排，使特定的第三人在经济、财产等方面遭受损失。比如，债务人与第三人恶意串通，低价转让财产，从而损害了债权人的债权实现。

在认定过程中，证据是关键。当事人需要提供能够证明双方存在恶意串通的证据，如双方的聊天记录、邮件往来、证人证言等。这些证据要能够清晰地反映出当事人的主观故意和客观行为。同时，法院也会根据案件的具体情况，综合考虑合同的签订背景、交易过程、交易价格是否合理等因素。

此外，法律规定为认定恶意串通合同无效提供了明确的依据。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，行为人与相对人恶意串通，损害他人合法权益的民事法律行为无效。这为司法实践中的认定提供了坚实的法律支撑。总之，认定恶意串通合同无效需要全面、综合地考量各种因素，以确保法律的公平正义得到实现。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第一百五十三条

违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。但是，该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外。

违背公序良俗的民事法律行为无效。

《中华人民共和国民法典》 第一百五十四条

行为人与相对人恶意串通，损害他人合法权益的民事法律行为无效。