买回迁房无房产证进行公证有一定效果，但不能完全保障权益。它能证明合同的签订是双方真实意思表示，具有一定证据效力，但无法像有房产证过户那样产生物权变动的效力。

从公证的意义和作用来看。公证是公证机构根据自然人、法人或者其他组织的申请，依照法定程序对民事法律行为、有法律意义的事实和文书的真实性、合法性予以证明的活动。在买回迁房无房产证的情况下，对购房合同进行公证，能够证明买卖双方签订合同这一行为是基于双方真实意愿，合同内容不违反法律法规的强制性规定。例如，公证可以证明双方约定的房屋价格、付款方式、交付时间等条款是双方协商一致的结果，在一定程度上增加了合同的可信度和证明力。

然而，需要明确的是，公证并不能解决回迁房无房产证这一核心问题。根据我国《民法典》规定，不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。回迁房没有房产证，意味着无法进行产权过户登记，即使进行了公证，房屋的所有权在法律上仍然没有转移给买方。也就是说，卖方仍然是法律意义上的房屋所有权人，存在卖方将房屋再次出售给他人或者因卖方自身债务问题导致房屋被法院查封等风险。

另外，虽然公证可以在一定程度上约束卖方的行为，但如果卖方违反合同约定，买方仅凭借公证书维权也可能面临诸多困难。比如，卖方拒绝交付房屋或者办理后续的产权登记手续，买方需要通过诉讼等途径来解决纠纷，而且最终能否实现合同目的还存在不确定性。

综上所述，买回迁房无房产证进行公证有一定的作用，但不能从根本上保障买方的权益。在购买此类房屋时，买方应充分了解相关风险，谨慎做出决策。

法律依据：

《城市房地产管理法》 第六十条

国家实行土地使用权和房屋所有权登记发证制度。

《民法典》 第二百零九条

不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。

第二百一十四条

不动产物权的设立、变更、转让和消灭，依照法律规定应当登记的，自记载于不动产登记簿时发生效力。