软件著作权登记证书本身没有有效期限制，但软件著作权受法律保护有一定期限。自然人的软件著作权，保护期为自然人终生及其死亡后50年，截止于自然人死亡后第50年的12月31日；软件是合作开发的，截止于最后死亡的自然人死亡后第50年的12月31日。法人或者其他组织的软件著作权，保护期为50年，截止于软件首次发表后第50年的12月31日，但软件自开发完成之日起50年内未发表的，不再受《计算机软件保护条例》保护。

软件著作权登记证书与软件著作权保护期限的关系。软件著作权登记证书是软件著作权人享有软件著作权的初步证明，它本身不存在有效期的计算问题。而我们所说的有效时间，实际上是指软件著作权受法律保护的时间范围。

自然人软件著作权保护期限计算。对于自然人的软件著作权，其保护期限从自然人完成软件创作开始起算，一直到该自然人死亡后50年。例如，某软件开发者在2000年开发完成一款软件，该开发者于2020年去世，那么这款软件的著作权保护期将截止到2070年的12月31日。如果软件是由多个自然人合作开发的，保护期则截止于最后死亡的自然人死亡后第50年的12月31日。

法人或其他组织软件著作权保护期限计算。法人或者其他组织开发的软件，其著作权保护期从软件首次发表开始计算，保护期为50年，截止于软件首次发表后第50年的12月31日。但存在一种特殊情况，如果软件自开发完成之日起50年内都没有发表，那么该软件将不再受到《计算机软件保护条例》的保护。例如，某公司在2000年开发完成一款软件，一直未发表，到2050年该软件就不再受相关条例保护了。

了解软件著作权登记证书所关联的软件著作权保护期限的计算方式，对于软件著作权人维护自身权益、合理规划软件的使用和传播等方面都具有重要意义。

法律依据：

《计算机软件保护条例》 第十四条

软件著作权自软件开发完成之日起产生。

自然人的软件著作权，保护期为自然人终生及其死亡后50年，截止于自然人死亡后第50年的12月31日；软件是合作开发的，截止于最后死亡的自然人死亡后第50年的12月31日。

法人或者其他组织的软件著作权，保护期为50年，截止于软件首次发表后第50年的12月31日，但软件自开发完成之日起50年内未发表的，本条例不再保护。