入伙协议和入股协议存在明显区别，也有一定联系。区别主要体现在适用主体、责任承担、加入程序等方面；联系在于二者都是一种加入行为的约定性文件，目的都是希望获取经济利益。

从适用主体来看，入伙协议主要适用于合伙企业。当新合伙人加入已经存在的合伙企业时，会签订入伙协议。例如甲、乙两人合伙开了一家小餐馆，后来丙想加入，此时甲、乙和丙三人就会签订入伙协议。而入股协议通常适用于公司，当股东认购公司股份时，签订的就是入股协议，像投资者购买上市公司股票，就会按要求签订相关的入股协议。

在责任承担方面，入伙协议中，新入伙的普通合伙人对入伙前合伙企业的债务承担无限连带责任，有限合伙人以其认缴的出资额为限对合伙企业债务承担责任。比如在上述餐馆合伙案例中，若餐馆入伙前有债务，普通合伙人丙要和甲、乙一起承担无限连带责任。而在入股协议中，股东一般以其认购的股份为限对公司承担责任，公司以其全部财产对公司的债务承担责任。

加入程序上，入伙协议需要原合伙人一致同意（合伙协议另有约定的除外），并且要依法订立书面入伙协议。新合伙人入伙时，还需要对合伙企业的经营状况和财务状况进行了解。而入股协议，如果是有限责任公司，新股东加入一般需要经过其他股东过半数同意；如果是股份有限公司，购买股票等入股相对程序较为简便。

它们的联系在于，二者本质上都是一种关于加入行为的约定性文件。无论是新合伙人通过入伙协议加入合伙企业，还是新股东通过入股协议加入公司，目的都是为了获取相应企业或公司的部分权益，进而从企业或公司的经营活动中获取经济利益，实现自身的投资目标。同时，入伙协议和入股协议都具有明确双方权利和义务的作用，保障加入者和原有成员之间的合法权益。

法律依据：

《中华人民共和国合伙企业法》 第四十四条

入伙的新合伙人与原合伙人享有同等权利，承担同等责任。入伙协议另有约定的，从其约定。

新合伙人对入伙前合伙企业的债务承担无限连带责任。

第四十三条

新合伙人入伙，除合伙协议另有约定外，应当经全体合伙人一致同意，并依法订立书面入伙协议。

订立入伙协议时，原合伙人应当向新合伙人如实告知原合伙企业的经营状况和财务状况。