若协议离婚房子归女方男方不配合过户，女方可先尝试与男方协商沟通，若协商无果，女方可以凭借离婚协议书向法院提起诉讼，拿到生效判决后申请强制执行，由法院向不动产登记机构发出协助执行通知书，进而完成过户手续。

在协议离婚的情况下，双方签订的离婚协议书是具有法律效力的。当协议明确房子归女方所有，而男方却不配合办理过户手续时，首先可以采取协商的方式。因为友好沟通有时能够解决问题，也许男方存在一些误解或者客观上的困难。女方可以与男方心平气和地交流，了解其不配合的原因，尝试共同寻找解决办法。比如，男方可能是因为工作繁忙没有时间，双方可以协商一个合适的时间一起去办理过户。

如果协商无法达成一致，女方就需要通过法律途径来维护自己的权益。女方可以向有管辖权的法院提起诉讼。在诉讼过程中，女方需要向法院提交离婚协议书等相关证据，证明房子按照协议约定应当归自己所有，而男方拒绝配合过户的事实。法院在审理后，如果认定离婚协议书合法有效，会依法作出判决，要求男方履行协助过户的义务。

一旦法院的判决生效，而男方仍然不履行判决内容，女方可以向法院申请强制执行。法院会向不动产登记机构发出协助执行通知书。不动产登记机构在收到法院的协助执行通知书后，会依据相关法律和法院的要求，协助女方办理房屋过户手续，将房屋产权登记到女方名下。这样，即便男方不配合，女方也能够通过法律程序完成房屋的过户，确保自己对房屋的合法权益得到实现。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第二百零九条

不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。

依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。