分居期间涉及小孩的手续主要包括户口登记、入学、医疗等方面，不同手续办理要求和流程不同，需根据具体情况准备相应材料按规定办理。

在分居期间，小孩相关手续的办理要依据具体需求来操作。首先是户口登记手续。根据《中华人民共和国户口登记条例》，婴儿出生后一个月以内，由户主、亲属、抚养人或者邻居向婴儿常住地户口登记机关申报出生登记。所需材料通常有婴儿的《出生医学证明》、父母双方的居民户口簿、居民身份证、结婚证等。如果父母分居且小孩户口要随其中一方落户，只要提供相应的证明材料，按照正常流程即可办理。

入学手续方面，一般孩子到了合适的年龄就要办理入学。各地的入学政策不同，通常需要准备孩子的户口本、出生证明、预防接种证等材料。有些地方还要求提供居住证明，如果父母分居，孩子跟随一方居住，那么以实际居住地址为准办理入学。可能需要提供该居住地址的房产证或者租房合同等相关证明，以证明孩子符合当地学校的招生范围。

医疗手续上，要为孩子办理医保。以城乡居民医保为例，一般在孩子出生后即可办理。需要准备孩子的户口本、监护人的身份证等材料，到当地的社保经办机构或者通过线上渠道办理参保登记手续。之后按照规定缴纳医保费用，孩子就能享受相应的医疗保障。

此外，如果涉及孩子抚养权的问题，在分居期间虽然没有正式离婚，但双方也可以通过协商确定孩子的抚养权归属。如果协商不成，也可以通过法律途径，向法院提起诉讼，由法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。在办理一些需要父母双方签字的手续时，如果抚养权已经明确，获得抚养权的一方在很多情况下可以代表孩子进行相关事务的处理。总之，分居期间小孩的各类手续办理要依据具体情况，准备好相应材料，按照规定的流程进行。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第二十六条

父母对未成年子女负有抚养、教育和保护的义务。

成年子女对父母负有赡养、扶助和保护的义务。

第一千零六十七条

父母不履行抚养义务的，未成年子女或者不能独立生活的成年子女，有要求父母给付抚养费的权利。

成年子女不履行赡养义务的，缺乏劳动能力或者生活困难的父母，有要求成年子女给付赡养费的权利。