刑事案件撤销案件后，公安机关应立即停止侦查活动，释放被羁押的犯罪嫌疑人，解除相关强制措施和侦查措施，对查封、扣押、冻结的财物及其孳息应妥善处理。如果已作出行政处罚决定，按照该决定执行；若发现新的事实或证据，符合立案条件的，可重新立案侦查。

在刑事诉讼中，当刑事案件被撤销后，有着一系列明确的处理流程和规定。公安机关作为主要的侦查机关，要马上停止针对该案件的一切侦查活动。这意味着不再进行调查取证、讯问犯罪嫌疑人等工作，将工作重点从该案件转移。

对于被采取强制措施的犯罪嫌疑人，需要及时处理。如果犯罪嫌疑人处于羁押状态，应立即释放，并发放释放证明。同时，解除之前采取的取保候审、监视居住等强制措施，及时通知被取保候审、监视居住人和有关单位。对于查封、扣押、冻结的财物及其孳息，应根据不同情况进行处理。如果与案件无关，应当在三日以内解除查封、扣押、冻结，予以退还；如果是违禁品或者不宜长期保存的物品，依照国家有关规定处理。

若在撤销案件前，已经对相关人员作出了行政处罚决定，那么就按照该行政处罚决定执行。比如因同一行为被刑事拘留后案件撤销，同时之前已作出行政拘留处罚的，依法执行行政拘留。

另外，撤销案件并不意味着一了百了。如果之后发现了新的事实或者证据，使得该案件重新符合立案条件，公安机关应当重新立案侦查。这体现了法律的严谨性和公正性，既保障了当事人的合法权益，也确保了对违法犯罪行为的准确打击。总之，刑事案件撤销后的处理有着严格的法律程序和要求，以维护司法的公正和权威。

法律依据：

《中华人民共和国刑法》 第三十七条

对于犯罪情节轻微不需要判处刑罚的，可以免予刑事处罚，但是可以根据案件的不同情况，予以训诫或者责令具结悔过、赔礼道歉、赔偿损失，或者由主管部门予以行政处罚或者行政处分。