合作违约金的计算以合同约定为基础，若合同未明确约定，则根据实际损失确定。司法实践中法院或仲裁机构会根据公平原则调整过高或过低的违约金，通常以实际损失为参照，兼顾合同履行情况、当事人过错程度等因素。

合作违约金的计算方式需结合合同约定与法律规定综合判断，具体可从以下维度展开分析：

一、合同约定是违约金计算的首要依据

1. 约定形式：当事人可在合同中明确违约金的计算方法，包括固定金额、按合同总额的比例、按日计算的逾期履行金等。书面合同中若存在“违约方应支付违约金XX元”或“按未履行金额的X%支付违约金”等条款，应优先按约定执行。若仅为口头约定，需提供录音、聊天记录等证据佐证，否则可能不被法院采信。

2. 常见计算方式：

固定金额：如“任何一方违约需支付违约金5万元”，适用于违约行为后果可预见的场景；

比例计算：常见按合同总金额的5%-20%约定，例如“违约金为合同总额的10%”；

按日计算：针对迟延履行义务，约定“每日按未支付款项的万分之五计算违约金”，累计总额通常不超过合同总额的30%（非强制性标准，仅供参考）。

二、无约定时按实际损失计算

若合同未约定违约金条款，守约方可依据《民法典》第五百八十四条主张赔偿损失，赔偿范围包括直接损失（如已支出的费用、为履行合同产生的合理开支）和间接损失（如可预期的利润损失，但需提供充分证据证明损失的必然性和可预见性）。例如，因对方违约导致原材料采购成本增加，该部分增加的费用可作为实际损失主张。

三、违约金调整的法定情形

根据《民法典》第五百八十五条，违约金过高或过低时，当事人可请求法院或仲裁机构调整：

1. 违约金过高的认定标准：若约定的违约金超过造成损失的30%，一般可认定为“过分高于造成的损失”。例如，合同总额100万元，约定违约金50万元，而实际损失仅10万元，违约方有权请求法院将违约金调低至13万元（10万元×130%）以内。

2. 违约金过低的调整：若约定的违约金低于实际损失，守约方可请求增加至实际损失额，但需举证证明损失的具体金额，如提供财务凭证、第三方评估报告等。

3. 调整的考量因素：法院调整违约金时会综合违约方的过错程度（故意违约或过失违约）、合同的履行进度（已履行大部分义务或未履行主要义务）、当事人的经济能力等因素，以实现公平与诚信原则的平衡。

四、司法实践中的特殊规则

1. 混合违约的处理：若双方均存在违约行为，法院可能根据过错比例分担责任，部分抵消违约金主张。例如，甲方迟延付款，乙方同时未按约定交付货物，法院可能分别计算双方违约金后进行折抵。

2. 惩罚性违约金的限制：对于商事主体之间的合作，若约定的违约金兼具惩罚性质（如远超实际损失），法院可能基于公平原则适当调低，但需尊重当事人的意思自治，非“明显过高”一般不予调整。

3. 举证责任分配：主张违约金过高的一方需举证证明违约金超出实际损失；主张违约金过低的一方需举证证明实际损失金额，无法举证可能承担不利后果。

五、实操建议

1. 签订合同时应明确违约金计算方式，避免使用“违约方承担一切损失”等模糊表述，可约定“违约金按合同总额的X%计算，且不低于XX元”以增强可执行性。

2. 发生违约时，守约方应及时固定证据（如违约通知函、催告记录、损失清单），避免因证据不足导致违约金主张无法全额支持。

3. 若对违约金金额存在争议，可先通过协商调整，协商不成可向法院或仲裁机构申请调整，起诉时需提交合同原件、损失证明材料等证据。

综上，合作违约金的计算需以合同约定为起点，结合法律规定和实际损失综合判定，当事人应重视合同条款的明确性，并在争议发生后通过合法途径维护权益。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第五百八十五条

当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。

约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。

当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。