医保和农村合作医疗在覆盖人群、缴费标准、报销比例、保障范围、管理部门等方面存在区别。

覆盖人群方面，医保主要面向城镇就业人员和非就业居民。其中，城镇职工医保针对的是各类企业、机关事业单位等的在职员工以及退休人员；城镇居民医保则覆盖了不属于城镇职工基本医疗保险制度覆盖范围的中小学阶段的学生、少年儿童和其他非从业城镇居民。而农村合作医疗也就是现在的城乡居民基本医疗保险（新农合已与城镇居民医保整合），主要覆盖农村居民。

缴费标准上，医保中的城镇职工医保缴费是由用人单位和职工共同缴纳，缴费金额通常较高，且缴费基数与工资挂钩。一般来说，单位缴费比例在6% - 10%左右，个人缴费比例为2%左右。城镇居民医保和城乡居民基本医疗保险实行个人缴费和政府补贴相结合，缴费标准相对较低。以2024年为例，城乡居民医保个人缴费标准最低为380元。

报销比例不同，城镇职工医保的报销比例通常较高，在住院报销方面，报销比例一般能达到70% - 90%。而城乡居民基本医疗保险报销比例相对较低，一般在50% - 70%左右。

保障范围上，城镇职工医保的保障范围相对较广，不仅包括住院费用报销，还涵盖门诊统筹、个人账户等。个人账户可用于支付门诊费用、药店购药等。城乡居民基本医疗保险主要侧重于住院费用报销，门诊保障相对较弱。

管理部门有差异，医保由人力资源和社会保障部门管理，而城乡居民基本医疗保险由卫生健康部门最初管理，整合后也由医保部门统一管理。

法律依据：

《工伤保险条例》 第三十三条

职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。

停工留薪期一般不超过12个月。伤情严重或者情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长不得超过12个月。工伤职工评定伤残等级后，停发原待遇，按照本章的有关规定享受伤残待遇。工伤职工在停工留薪期满后仍需治疗的，继续享受工伤医疗待遇。

生活不能自理的工伤职工在停工留薪期需要护理的，由所在单位负责。