协议离婚和法院判决离婚在程序、适用条件、效力等方面存在明显区别。协议离婚是夫妻双方自愿达成离婚协议后到婚姻登记机关办理离婚手续；法院判决离婚则是一方向法院提起离婚诉讼，由法院审理后作出是否准予离婚的判决。

在程序方面，协议离婚有一套固定的流程。夫妻双方需先签订书面离婚协议，协议中要对子女抚养、财产及债务处理等事项协商一致。双方共同到一方当事人常住户口所在地的婚姻登记机关申请离婚登记。申请后有30天的冷静期，冷静期内任何一方反悔都可撤回申请。冷静期届满后30天内，双方需再次共同到婚姻登记机关申请发给离婚证，经审查符合条件的，予以登记并发证。而法院判决离婚，一方向有管辖权的法院提起离婚诉讼，提交起诉状和相关证据。法院受理后会进行调解，调解贯穿整个诉讼过程。若调解无效，法院会根据庭审情况和证据进行判决。

适用条件不同。协议离婚要求夫妻双方自愿离婚，且对离婚相关事项达成一致意见。如果双方在子女抚养、财产分割等问题上存在较大分歧，无法协商一致，就不能选择协议离婚。法院判决离婚主要看夫妻感情是否确已破裂。根据法律规定，如重婚或者与他人同居、实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员、有赌博、吸毒等恶习屡教不改、因感情不和分居满二年等情形，调解无效的，应当准予离婚。

效力也有差异。协议离婚的离婚协议书经婚姻登记机关备案后生效，但不具有强制执行力。如果一方不履行协议内容，另一方需向法院起诉，待获得生效判决后才能申请强制执行。法院判决离婚的判决书一旦生效，即具有强制执行力，一方不履行判决内容，另一方可以直接向法院申请强制执行。

从时间成本来看，协议离婚若顺利，整个过程可能在一个多月内完成。而法院判决离婚，简易程序一般在3个月内审结，普通程序则可能需要6个月甚至更长时间，若涉及上诉，时间会更久。

法律依据：

《中华人民共和国民事诉讼法》 第二百五十四条

被执行人未按执行通知履行法律文书确定的义务，人民法院有权扣留、提取被执行人应当履行义务部分的收入。但应当保留被执行人及其所扶养家属的生活必需费用。

人民法院扣留、提取收入时，应当作出裁定，并发出协助执行通知书，被执行人所在单位、银行、信用合作社和其他有储蓄业务的单位必须办理。