开车扣分扣的是驾驶证，而非行驶证。行驶证是准予机动车在我国境内道路上行驶的法定证件，记录的是车辆信息；驾驶证是证明驾驶员具备驾驶资格的证件，扣分针对的是驾驶员的交通违法行为。

首先要明确行驶证和驾驶证的不同性质。行驶证是车辆的“身份证”，它记录了车辆的基本信息，如车辆类型、车主信息、车辆识别代码等，其作用是证明车辆具有合法上路行驶的资格。而驾驶证是驾驶员的“资格证”，它证明持证人经过了相关的培训和考核，具备了在道路上驾驶相应类型机动车的能力。

交通管理部门对交通违法行为进行扣分，是基于驾驶员的行为。当驾驶员在驾驶过程中违反交通规则时，会根据具体的违法行为对应的扣分标准，在其驾驶证上扣除相应的分数。例如，闯红灯会扣6分，超速行驶根据超速的比例不同会有不同的扣分情况。

扣分的目的是规范驾驶员的驾驶行为，促使其遵守交通法规，保障道路交通安全。如果是扣行驶证的分，就无法起到约束驾驶员行为的作用，因为行驶证与车辆绑定，而车辆可能由不同的驾驶员驾驶。

在处理交通违法时，交警通常会要求驾驶员出示驾驶证和行驶证。确认违法行为后，会在驾驶证上进行扣分操作，并开具相应的处罚决定书。驾驶员需要在规定的时间内处理违章，缴纳罚款，否则可能会产生滞纳金，并且在驾驶证记分周期结束时，如果扣分未处理，会影响下一个记分周期的分数清零。

开车扣分是针对驾驶员的驾驶证，而不是车辆的行驶证。这一制度设计有助于维护交通秩序，保障交通安全。

法律依据：

《中华人民共和国刑法》 第一百四十四条

在生产、销售的食品中掺入有毒、有害的非食品原料的，或者销售明知掺有有毒、有害的非食品原料的食品的，处五年以下有期徒刑，并处罚金；对人体健康造成严重危害或者有其他严重情节的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；致人死亡或者有其他特别严重情节的，依照本法第一百四十一条的规定处罚。