醉驾定案后若证据不足，根据所处的诉讼阶段不同会有不同的处理方式。在侦查阶段可能会撤销案件，在审查起诉阶段检察院可能会作出不起诉决定，在审判阶段法院可能会作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。

首先在侦查阶段，公安机关对醉驾案件立案后进行侦查。如果在侦查过程中发现证据不足，不符合起诉条件，比如血液酒精含量检测程序存在严重瑕疵，或者缺乏足够证据证明嫌疑人驾驶机动车等情况，公安机关应当撤销案件。这是因为要遵循“以事实为依据，以法律为准绳”的原则，没有充分证据就不能随意将案件继续推进，保障当事人的合法权益不受无端侵害。

当案件移送到检察院审查起诉时，检察院会对证据进行全面审查。如果认为醉驾案件证据不足，不符合起诉条件的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。经过补充侦查后，仍然证据不足，不符合起诉条件的，检察院应当作出不起诉的决定。不起诉意味着嫌疑人不会被追究刑事责任，诉讼程序在此阶段终结。

若案件已经进入到审判阶段，法院在审理过程中，如果发现证据不足，不能认定被告人有罪的，应当作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。法院有严格的证据审查标准和定罪量刑标准，必须在证据确实、充分的情况下才能认定被告人有罪。如果证据无法形成完整的证据链，达到排除合理怀疑的证明标准，就不能对被告人作出有罪判决。比如在一些醉驾案件中，证人证言相互矛盾，又缺乏有效的客观证据支持，法院就可能会基于证据不足作出无罪判决，确保司法公正和审判质量。

法律依据：

《中华人民共和国刑事诉讼法》 第一百七十五条

人民检察院审查案件，可以要求公安机关提供法庭审判所必需的证据材料;认为可能存在本法第五十六条规定的以非法方法收集证据情形的，可以要求其对证据收集的合法性作出说明。

人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。

对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查起诉期限。

对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。