延期3年返还工资，个税计算需区分不同情况。若属于补发以前月份工资，可按规定分摊到所属月份与该月工资合并计算个税；若属于正常工资延迟发放，通常并入发放当月工资收入，按照综合所得适用税率计算缴纳个税。

根据《个人所得税法》，居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率。

对于补发以前月份工资的情况，部分地区有特殊规定，允许将补发工资分摊到所属月份计算个税。例如，某员工正常工资每月5000元，因企业资金问题，将过去3年（36个月）的工资延期到现在一次性发放，若当地允许分摊计算，就把这3年的工资总额除以36，得到每月应分摊的工资数额，再将其与所属月份原本应发工资合并，按照综合所得税率表计算该月应缴纳的个税，最后将36个月的个税相加得出应纳税总额。

若当地没有允许分摊计算的政策，或者该情况不属于补发以前月份工资，而是正常工资延迟发放，那么就应将这延期3年返还的工资全部并入发放当月的工资收入中。假设该员工当月正常工资加上延期3年返还的工资共计20万元，先扣除当月的减除费用5000元、专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后，得到应纳税所得额。然后根据综合所得适用税率表找到对应的税率和速算扣除数，计算公式为：应纳税额 = 应纳税所得额×适用税率 - 速算扣除数。

需要注意的是，不同地区对于工资延期发放的个税计算政策可能存在差异。纳税人应及时关注当地税务机关的具体规定，也可以向当地税务机关咨询或拨打12366纳税服务热线，以确保准确计算和缴纳个人所得税，避免因计算错误导致税务风险。

法律依据：

《中华人民共和国个人所得税法》 第二条

下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：

（一）工资、薪金所得；

（二）劳务报酬所得；

（三）稿酬所得；

（四）特许权使用费所得；

（五）经营所得；

（六）利息、股息、红利所得；

（七）财产租赁所得；

（八）财产转让所得；

（九）偶然所得。