违法加盟的赔偿计算需依据具体违法情形以及给加盟商造成的实际损失来确定，常见计算方式有按照合同约定赔偿、赔偿实际损失、惩罚性赔偿等。

在加盟活动中，若存在违法情况，赔偿的计算较为复杂，需综合多方面因素考量。

首先是按照合同约定赔偿。如果加盟合同中明确约定了一方违约（违法加盟通常可视为违约情形）时的赔偿方式或具体赔偿金额，那么在发生违法加盟情况时，应按照合同约定执行。例如，合同约定若加盟公司未按约定提供特定的经营指导服务，需向加盟商支付一定金额的违约金，这种情况下就依据该约定来确定赔偿数额。

其次是赔偿实际损失。当合同没有约定赔偿方式时，就需要计算加盟商因加盟方的违法行为所遭受的实际损失。实际损失包括直接损失和间接损失。直接损失如加盟商为加盟项目支付的加盟费、保证金、装修费用、设备采购费用等实际支出。间接损失则是指因加盟方的违法行为导致加盟商预期可得利益的损失，比如因加盟公司提供的产品质量不合格，导致加盟店销售额下降，这部分减少的利润就属于间接损失。在计算实际损失时，加盟商需要提供充分的证据来证明损失的存在和具体数额，如发票、财务报表、销售记录等。

再者是惩罚性赔偿。在某些特定情况下，加盟方的违法行为可能构成欺诈等严重情形，根据相关法律规定，加盟商有权要求惩罚性赔偿。例如，加盟公司故意隐瞒重要信息或提供虚假信息，诱使加盟商签订加盟合同，加盟商除了要求赔偿实际损失外，还可以要求加盟公司按照一定倍数（通常为一倍以上三倍以下）赔偿损失。

此外，在确定赔偿数额时，法院还会考虑双方的过错程度。如果加盟商自身也存在一定过错，可能会相应减轻加盟方的赔偿责任。总之，违法加盟的赔偿计算需要根据具体案件情况，结合法律规定和证据来综合判断。

法律依据：

《商业特许经营管理条例》 第三条

本条例所称商业特许经营（以下简称特许经营），是指拥有注册商标、企业标志、专利、专有技术等经营资源的企业（以下称特许人），以合同形式将其拥有的经营资源许可其他经营者（以下称被特许人）使用，被特许人按照合同约定在统一的经营模式下开展经营，并向特许人支付特许经营费用的经营活动。

企业以外的其他单位和个人不得作为特许人从事特许经营活动。