小产权房与大产权房在产权归属、合法性、交易风险、土地性质、建设标准及配套设施等方面存在明显区别。

产权归属方面，大产权房的业主拥有完整产权，包括房屋所有权和土地使用权，其产权受国家法律保护，可以自由上市交易、抵押、继承等。而小产权房的产权并不完整，购房者只有房屋的使用权，没有土地使用权，其产权证书一般由乡镇政府或村集体颁发，并非国家房管部门，不被国家认可。

合法性层面，大产权房是经过国家相关部门审批，按照法定程序建设的，具备完整的五证，即《国有土地使用证》《建设用地规划许可证》《建设工程规划许可证》《建筑工程施工许可证》《商品房预售许可证》。小产权房通常是在集体土地上建设，未经过正规的土地征收和审批程序，违反了土地管理法规，属于违规建筑。

交易风险上，大产权房交易相对安全，有完善的法律保障和规范的交易流程。小产权房由于缺乏合法的产权证明，交易不受法律保护，存在诸多风险。比如，可能面临房屋被拆除而得不到补偿的情况，而且在转让时也会受到诸多限制，难以实现自由流转。

土地性质不同，大产权房的土地性质为国有土地，开发商通过合法的土地出让方式取得土地使用权。小产权房的土地一般是集体所有，如农村宅基地或集体建设用地。

建设标准及配套设施方面，大产权房的建设要符合国家相关的建筑标准和规范，配套设施相对完善，包括基础设施、公共服务设施等。小产权房在建设过程中往往缺乏有效的监管，质量难以保证，配套设施也可能不齐全，影响居住的舒适度和便利性。

法律依据：

《城市房地产管理法》 第六十条

国家实行土地使用权和房屋所有权登记发证制度。

《民法典》 第二百零九条

不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。

第二百一十四条

不动产物权的设立、变更、转让和消灭，依照法律规定应当登记的，自记载于不动产登记簿时发生效力。