重大责任事故罪和危险作业罪在犯罪构成、行为阶段、刑罚设置等方面存在区别。危险作业罪是危险犯，强调具有发生重大伤亡事故或其他严重后果的现实危险；重大责任事故罪是结果犯，要求已造成重大伤亡事故或其他严重后果。

1. 犯罪构成不同：危险作业罪是《刑法修正案（十一）》新增罪名，规定在生产、作业中违反有关安全管理的规定，具有发生重大伤亡事故或者其他严重后果的现实危险的三种情形，包括关闭、破坏直接关系生产安全的监控、报警、防护、救生设备、设施，或者篡改、隐瞒、销毁其相关数据、信息的；因存在重大事故隐患被依法责令停产停业、停止施工、停止使用有关设备、设施、场所或者立即采取排除危险的整改措施，而拒不执行的；涉及安全生产的事项未经依法批准或者许可，擅自从事矿山开采、金属冶炼、建筑施工，以及危险物品生产、经营、储存等高度危险的生产作业活动的，构成此罪。而重大责任事故罪是在生产、作业中违反有关安全管理的规定，因而发生重大伤亡事故或者造成其他严重后果才构成犯罪，是结果犯。

2. 行为阶段不同：危险作业罪处罚的是在生产作业过程中，违反安全管理规定，具有发生严重后果现实危险的行为，是对安全事故发生前的危险行为进行规制，属于事前预防。重大责任事故罪则是在事故发生后，对相关责任人员进行刑事处罚，是对结果的惩处。

3. 刑罚设置不同：危险作业罪的刑罚为处一年以下有期徒刑、拘役或者管制。重大责任事故罪，处三年以下有期徒刑或者拘役；情节特别恶劣的，处三年以上七年以下有期徒刑。

4. 主观方面差异：两者主观上虽然都是过失，但危险作业罪行为人可能对违反安全管理规定的行为有一定故意，只是对可能发生的严重后果持过失态度。重大责任事故罪行为人对违反安全管理规定可能也是故意，但更强调对造成的严重后果是过失心态。

法律依据：

《中华人民共和国刑法》 第一百三十四条之一

在生产、作业中违反有关安全管理的规定，有下列情形之一，具有发生重大伤亡事故或者其他严重后果的现实危险的，处一年以下有期徒刑、拘役或者管制：

（一）关闭、破坏直接关系生产安全的监控、报警、防护、救生设备、设施，或者篡改、隐瞒、销毁其相关数据、信息的；

（二）因存在重大事故隐患被依法责令停产停业、停止施工、停止使用有关设备、设施、场所或者立即采取排除危险的整改措施，而拒不执行的；

（三）涉及安全生产的事项未经依法批准或者许可，擅自从事矿山开采、金属冶炼、建筑施工，以及危险物品生产、经营、储存等高度危险的生产作业活动的。