高速公路路肩停车一般扣3分。但如果是在发生故障等紧急情况下，按规定停车并设置警示标志等，不会被扣分处罚；若在非紧急情况下停车，除扣3分外，还会处20元以上200元以下罚款。

高速公路路肩是在道路两侧供车辆临时停靠、发生故障等紧急情况使用的区域，并非供正常行驶车辆随意停车的地方。

不同情况的处罚规定

在正常情况下，非紧急情形下在高速公路路肩停车，根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，驾驶机动车在高速公路或者城市快速路上违法占用应急车道行驶的，一次记3分。同时，依据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条规定，机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者20元以上200元以下罚款。

然而，如果是车辆突发故障、驾驶员突发疾病等紧急情况，无法正常行驶至服务区或出口，在路肩停车是被允许的。不过，必须严格按照规定操作，要立即开启危险报警闪光灯，将三角警示牌设置在来车方向一百五十米以外（夜间、雨雾等恶劣天气还应适当增加距离），车上人员应迅速转移到右侧路肩上或者应急车道内，并迅速报警。这种情况下，经核实是符合紧急情况的，不会被认定为违法停车进行扣分和罚款处罚。

高速公路上车速快，随意在路肩停车会严重影响交通安全，不仅可能导致后方车辆避让不及引发追尾等事故，还会干扰正常的交通秩序。所以，驾驶员应严格遵守交通法规，非紧急情况切勿在高速公路路肩停车。

法律依据：

《道路交通安全违法行为记分管理办法》 第九条

机动车驾驶人有下列交通违法行为之一，一次记9分：

（一）驾驶7座以上载客汽车载人超过核定人数百分之五十以上未达到百分之百的；

（二）驾驶校车、中型以上载客载货汽车、危险物品运输车辆在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶超过规定时速百分之五十以上的；

（三）驾驶机动车在高速公路或者城市快速路上违法停车的；

（四）驾驶未悬挂机动车号牌或者故意遮挡、污损机动车号牌的机动车上道路行驶的；

（五）驾驶与准驾车型不符的机动车的；

（六）未取得校车驾驶资格驾驶校车的；

（七）连续驾驶中型以上载客汽车、危险物品运输车辆超过4小时未停车休息或者停车休息时间少于20分钟的。