建设工程施工许可证由建设单位办理。

在建设工程领域，依据相关法律法规，明确规定建设工程施工许可证的办理主体为建设单位。这是因为建设单位是工程项目的发起者和组织者，对整个建设项目负有全面的责任和义务。

从项目的整体规划来看，建设单位在项目立项、土地获取、设计委托等前期工作中处于主导地位。施工许可证的办理是工程项目合法开工的重要前置条件，建设单位有能力和义务协调各方资源来完成这一手续。例如，办理施工许可证需要提交一系列的文件和资料，像建设用地规划许可证、建设工程规划许可证、施工图纸及技术资料、施工企业的资质证书等。建设单位在项目推进过程中，有条件整合这些材料，确保申请资料的完整性和准确性。

从法律责任角度分析，建设单位作为项目的责任主体，办理施工许可证也是其承担法律责任的体现。未取得施工许可证擅自施工属于违法行为，建设单位将面临相应的行政处罚，如责令停止施工、限期改正，并处以罚款等。这就要求建设单位严格按照规定办理施工许可证，以保障工程建设活动的合法性和规范性。

此外，施工许可证的办理涉及到多个政府部门的审批，建设单位能够以项目法人的身份与各部门进行沟通和对接，顺利完成审批流程。而施工单位主要负责工程的具体施工工作，其工作重点在于按照合同要求和施工规范进行工程建设，将办理施工许可证的责任赋予建设单位，更有利于工程建设的有序开展和管理。

法律依据：

《中华人民共和国建筑法》 第七条

建筑工程开工前，建设单位应当按照国家有关规定向工程所在地县级以上人民政府建设行政主管部门申请领取施工许可证；但是，国务院建设行政主管部门确定的限额以下的小型工程除外。按照国务院规定的权限和程序批准开工报告的建筑工程，不再领取施工许可证。

《中华人民共和国建筑法》 第六十四条

违反本法规定，未取得施工许可证或者开工报告未经批准擅自施工的，责令改正，对不符合开工条件的责令停止施工，可以处以罚款。