公司变更法人代表后，公司的债务仍由公司本身承担责任，而非变更后的法定代表人承担。

需要明确公司是独立的法人主体，拥有独立的财产权。根据《中华人民共和国民法典》和《中华人民共和国公司法》等相关法律规定，公司以其全部财产对公司的债务承担责任。法定代表人只是代表公司进行民事活动的负责人，法定代表人的变更并不影响公司的独立法人地位和其对债务的承担。

从法律关系角度来看，公司债务是基于公司的经营活动而产生的，与公司的法人身份紧密相连。公司在经营过程中与债权人形成的债权债务关系，是公司作为债务人与债权人之间的关系，并非与法定代表人个人之间的关系。例如，公司在向银行贷款时，贷款合同的主体是公司和银行，银行是债权人，公司是债务人，法定代表人只是代表公司在合同上签字等。即使后续公司变更了法定代表人，银行依然是向公司主张债权，要求公司偿还贷款。

在实际操作中，变更法定代表人只是公司内部的人事变动。公司的资产、负债等财务状况不会因为法定代表人的变更而发生本质改变。公司的债务依然会记录在公司的财务报表中，由公司按照既定的还款计划或法律规定进行偿还。

不过，如果法定代表人在担任职务期间存在滥用职权、损害公司利益等行为，导致公司产生债务或加重债务负担，在这种情况下，法定代表人可能需要对其行为承担相应的法律责任，但这与公司本身对债务的承担是不同的法律关系。例如，原法定代表人擅自以公司名义为其个人债务提供担保，给公司造成损失，公司在承担担保责任后，可以向该法定代表人进行追偿。

综上所述，公司变更法人代表后，公司的债务由公司承担，这是基于公司的独立法人地位和相关法律规定所确定的原则。

法律依据：

《中华人民共和国公司法》 第三条

公司是企业法人，有独立的法人财产，享有法人财产权。公司以其全部财产对公司的债务承担责任。

有限责任公司的股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任；股份有限公司的股东以其认购的股份为限对公司承担责任。

《中华人民共和国公司法》 第四条

公司股东依法享有资产收益、参与重大决策和选择管理者等权利。