刑事案件调卷需根据案件所处的诉讼阶段及具体情况，向侦查机关、检察机关、审判机关的办案部门或档案管理部门申请，案件审结后则需联系相关机关的档案管理部门。不同阶段对应的调卷部门存在差异，需结合案件进展及调卷主体身份确定具体部门。

刑事案件调卷的部门因案件所处诉讼阶段、调卷主体身份的不同而存在差异，需结合具体情况分析。

一、侦查阶段：向侦查机关办案部门或档案管理部门申请

侦查阶段案件由侦查机关负责，包括公安机关、国家安全机关、海关缉私局、监狱等（依据《刑事诉讼法》第3条）。此阶段调卷主体主要为辩护律师，根据《刑事诉讼法》第40条，辩护律师在侦查期间虽不能查阅全部案卷材料，但可向侦查机关了解犯罪嫌疑人涉嫌的罪名和案件有关情况。若需调取部分程序性材料（如拘留证、逮捕证等），可向侦查机关的办案部门（如刑警队、经侦支队）或内部档案管理部门申请，需提交律师执业证、委托书、律所证明等材料。

二、审查起诉阶段：向检察机关公诉部门或案件管理部门申请

案件移送审查起诉后，检察机关成为案卷保管主体。根据《刑事诉讼法》第40条，辩护律师自人民检察院对案件审查起诉之日起，可以查阅、摘抄、复制本案的案卷材料。此时调卷部门为检察院的公诉部门（负责案件审查起诉）或案件管理部门（统一受理律师阅卷申请）。实践中，多数检察院设立案件管理中心，集中处理律师阅卷事宜，律师需持执业证、委托书、律所证明到案件管理中心办理，部分检察院支持线上阅卷申请，提升效率。

三、审判阶段：向法院案件承办部门或档案室申请

案件进入审判程序后，法院成为案卷保管主体。辩护律师可向法院申请查阅案卷，调卷部门通常为案件承办部门（承办法官或书记员）或法院档案室。根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国刑事诉讼法〉的解释》第53条，辩护律师可以查阅、摘抄、复制案卷材料，包括起诉书、证据材料、庭审笔录等。若案件处于一审阶段，向一审法院承办部门申请；若为上诉、抗诉案件，二审法院需调取一审案卷，律师可向二审法院申请查阅，或联系一审法院档案室调取。

四、案件审结后：向相关机关档案管理部门申请

刑事案件审结后（包括判决生效、不起诉、撤诉等），案卷会按规定归档。法院审结的案件，案卷存入法院档案室；检察院不起诉的案件，案卷留存检察院档案室；侦查机关撤销案件的，案卷由侦查机关档案部门保管。此时调卷需向对应的档案管理部门申请，需符合档案查询规定，如律师需提供执业证、委托书、律所证明，其他单位（如纪检监察机关）调卷可能需持单位公函及办案人员证件。

五、特殊主体调卷的注意事项

除辩护律师外，其他主体调卷程序不同。例如，当事人本人调卷需经办案机关同意，且可能受限；纪检监察机关因办案需要调卷，需依据《监察法》规定，通过公函形式向相关机关调取；其他司法机关因案件关联调卷，需遵循办案协作规定。调卷时需明确自身身份，准备齐全所需材料，避免因程序不符导致无法调卷。

综上，刑事案件调卷需结合案件阶段、调卷主体确定具体部门，辩护律师等专业主体应依据法律规定，向侦查机关、检察机关、审判机关的办案部门或档案管理部门申请，确保调卷程序合法、高效。

法律依据：

《中华人民共和国刑事诉讼法》 第四十条

辩护律师自人民检察院对案件审查起诉之日起，可以查阅、摘抄、复制本案的案卷材料。其他辩护人经人民法院、人民检察院许可，也可以查阅、摘抄、复制上述材料。

《中华人民共和国刑事诉讼法》 第四十三条

辩护律师经证人或者其他有关单位和个人同意，可以向他们收集与本案有关的材料，也可以申请人民检察院、人民法院收集、调取证据，或者申请人民法院通知证人出庭作证。辩护律师经人民检察院或者人民法院许可，并且经被害人或者其近亲属、被害人提供的证人同意，可以向他们收集与本案有关的材料。