夫妻分居后债务关系的处理需先区分债务是个人债务还是夫妻共同债务，个人债务由个人承担，共同债务一般由夫妻共同承担。对于共同债务，双方可协商分担比例，协商不成可由法院判决。

在处理夫妻分居后债务关系时，首先要明确债务的性质。根据法律规定，夫妻共同债务是指为满足夫妻共同生活需要所负的债务，包括夫妻共同从事生产、经营活动所负的债务，或者一方从事生产经营活动，经营收入用于家庭生活或配偶分享所负的债务等。而夫妻个人债务是指夫妻约定为个人负担的债务或者一方从事无关家庭共同生活时所产生的债务。

如果是夫妻共同债务，即使夫妻分居，双方也有共同偿还的责任。在双方婚姻关系存续期间，债权人就一方以夫妻名义所负债务主张权利的，一般按夫妻共同债务处理，但夫妻一方能够证明债权人与债务人明确约定为个人债务，或者能够证明属于《民法典》规定情形的除外。也就是说，当债权人向夫妻双方主张偿还债务时，夫妻双方都有义务偿还。

夫妻双方可以就债务的分担进行协商。在分居期间，双方可以根据各自的经济状况、债务的形成原因等因素，协商确定各自承担的债务比例。例如，某笔债务是因一方经营生意所产生，但经营收入用于了家庭生活，双方可以协商由经营方多承担一部分债务。

若夫妻双方协商不成，可通过法律途径解决。法院在审理时，会依据相关法律规定和实际情况进行判决。法院会审查债务的用途、双方的经济状况等因素，以确定合理的债务分担方式。

对于夫妻个人债务，由负债一方独自承担偿还责任。比如一方因赌博等非法活动所负的债务，另一方无需承担偿还责任。处理夫妻分居后债务关系要遵循法律规定，结合实际情况合理解决。

法律依据：

《民法典》 第五百八十五条

当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。