摩托车套牌车被交警抓了后，需要携带行驶证、驾驶证、行政处罚决定书等相关证件和材料前往指定的交警部门处理违章。通常会面临罚款、拘留、扣车以及吊销驾驶证等处罚，需按要求缴纳罚款、接受拘留等处罚措施，之后才能领回被扣押车辆。

根据《中华人民共和国道路交通安全法》规定，使用其他车辆的机动车登记证书、号牌、行驶证、检验合格标志、保险标志的，由公安机关交通管理部门予以收缴，扣留该机动车，处二千元以上五千元以下罚款。伪造、变造或者使用伪造、变造的机动车登记证书、号牌、行驶证、驾驶证的，由公安机关交通管理部门予以收缴，扣留该机动车，处十五日以下拘留，并处二千元以上五千元以下罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。

当摩托车套牌车被交警查获后，首先交警会依法扣留车辆。驾驶人应在规定时间内，携带本人身份证、驾驶证、车辆相关资料以及交警开具的行政处罚决定书等，前往指定的交警大队或违章处理中心。在处理违章时，工作人员会根据具体情况进行详细的调查和核实。驾驶人需要如实陈述情况，配合交警的工作。

对于罚款部分，驾驶人要按照处罚决定书上指定的银行和金额，在规定的时间内完成缴纳。如果逾期未缴纳，可能会产生滞纳金。关于拘留处罚，如果涉及到伪造、变造号牌等严重情况，驾驶人必须按照要求到指定地点接受相应天数的拘留。

在完成罚款缴纳和接受完其他处罚后，驾驶人可以申请领回被扣留的摩托车。领车时，要确保车辆的手续齐全、合法，并且车辆符合上路行驶的安全标准。摩托车套牌是严重的交通违法行为，不仅会扰乱正常的交通秩序，还会给自己和他人带来安全隐患，因此要严格遵守交通法规。

法律依据：

《中华人民共和国道路交通安全法》 第九十六条

伪造、变造或者使用伪造、变造的机动车登记证书、号牌、行驶证、驾驶证的，由公安机关交通管理部门予以收缴，扣留该机动车，处15日以下拘留，并处2000元以上5000元以下罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。

伪造、变造或者使用伪造、变造的检验合格标志、保险标志的，由公安机关交通管理部门予以收缴，扣留该机动车，处10日以下拘留，并处1000元以上3000元以下罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。

使用其他车辆的机动车登记证书、号牌、行驶证、检验合格标志、保险标志的，由公安机关交通管理部门予以收缴，扣留该机动车，处2000元以上5000元以下罚款。