代驾违章通常会扣代驾的分并对其进行罚款。

在代驾过程中，如果发生违章行为，从法律层面来讲，责任主体是实际驾驶车辆的人，也就是代驾司机。交通违章的认定是基于实际的违章行为和驾驶人，所以一般情况下会对代驾司机的驾驶证进行扣分，同时根据违章的具体情况对代驾司机处以相应的罚款。

从实际操作来看，当代驾违章被电子眼抓拍时，由于电子眼无法直接识别驾驶人，可能会先将违章记录在车辆上。此时车主需要协助代驾处理违章。如果是现场被交警查处的违章，交警会直接对代驾司机进行处理，开具罚单，明确扣分和罚款情况。

不过，在代驾行业中，代驾公司通常会有相关的规定和流程。有些代驾公司会要求代驾司机自行承担违章的后果，包括扣分和缴纳罚款。如果代驾司机不及时处理，公司可能会采取一些措施，比如从代驾司机的账户中扣除相应的费用来处理违章，或者对代驾司机进行一定的处罚，如警告、暂停代驾服务等。

对于车主而言，虽然代驾违章的责任主要在代驾司机，但车主也需要关注违章处理情况。因为如果违章不及时处理，可能会影响车辆的年检等业务。车主在代驾服务完成后，应及时与代驾司机沟通违章情况，确保违章得到妥善处理。代驾违章一般是扣代驾的分和罚款，但整个处理过程需要代驾司机、车主和代驾公司等各方的配合。

法律依据：

《中华人民共和国道路交通安全法》 第八十八条

对道路交通安全违法行为的处罚种类包括：警告、罚款、暂扣或者吊销机动车驾驶证、拘留。

《中华人民共和国道路交通安全法》 第九十条

机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。本法另有规定的，依照规定处罚。