公司股权变更流程主要包括内部决议、签署协议、工商登记变更等步骤，同时可能涉及税务申报等相关事宜。

做出内部决议。有限责任公司进行股权变更时，需要召开股东会并形成同意股权转让的决议。如果是股东向股东以外的人转让股权，需经其他股东过半数同意。股东应就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意，其他股东自接到书面通知之日起满三十日未答复的，视为同意转让。其他股东半数以上不同意转让的，不同意的股东应当购买该转让的股权；不购买的，视为同意转让。

签署股权转让协议。转让方和受让方需签订正式的股权转让协议，明确双方的权利和义务，包括转让的股权份额、转让价格、支付方式、违约责任等重要条款。协议的内容要符合法律法规和公司章程的规定。

然后办理工商登记变更。携带相关材料到工商行政管理部门办理股权变更登记手续。所需材料一般包括公司法定代表人签署的《公司变更登记申请书》、公司签署的《指定代表或者共同委托代理人的证明》及指定代表或委托代理人的身份证件复印件、股东会决议、股权转让协议、新股东的主体资格证明或自然人身份证件复印件等。工商部门会对提交的材料进行审核，审核通过后，将进行股权变更登记，换发营业执照。

还涉及税务申报。股权变更可能会产生个人所得税或企业所得税等纳税义务。转让方为个人的，需缴纳个人所得税，以股权转让收入减除股权原值和合理费用后的余额为应纳税所得额，按“财产转让所得”缴纳个人所得税。转让方为企业的，需缴纳企业所得税。企业应就股权转让所得并入企业的应纳税所得额，依法缴纳企业所得税。同时，还可能涉及印花税，股权转让合同应按产权转移书据缴纳印花税。完成税务申报和缴纳后，取得完税证明。

公司内部还需要进行相应的变更，如修改公司章程、变更股东名册等，以确保公司内部记录与工商登记信息一致。通过以上一系列流程，才能完成公司股权的合法变更。

法律依据：

《中华人民共和国劳动合同法》 第三条

订立劳动合同，应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。

依法订立的劳动合同具有约束力，用人单位与劳动者应当履行劳动合同约定的义务。

《中华人民共和国劳动合同法》 第七条

用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系。用人单位应当建立职工名册备查。