酒后驾驶摩托车被扣后，需要先确认酒驾程度，若为饮酒驾驶，需在规定时间内携带相关证件到指定地点接受处理，缴纳罚款、参加学习并通过考试后可领回驾驶证；若为醉酒驾驶，驾驶证会被吊销，还可能面临刑事处罚，处理流程更为复杂。

首先要明确酒驾分为饮酒驾驶和醉酒驾驶两种情况，其处理方式有所不同。

对于饮酒驾驶摩托车的情况：

当驾驶人因酒后驾驶摩托车被交警扣车和扣证后，会收到交警部门出具的处罚决定书。驾驶人需在规定的15日内，携带身份证、驾驶证暂扣凭证等相关证件，前往交通管理部门指定的地点接受处理。通常，饮酒驾驶摩托车会面临罚款和暂扣驾驶证的处罚。罚款金额一般在1000元以上2000元以下。之后，驾驶人要参加为期7天的道路交通安全法律、法规和相关知识学习。学习结束后，在20日内参加科目一的考试。考试合格后，记分予以清除，发还机动车驾驶证。在缴纳完罚款、完成学习和考试后，就可以凭借相关凭证到指定地点领回被扣留的摩托车。

对于醉酒驾驶摩托车的情况：

醉酒驾驶属于更为严重的违法行为。一旦被认定为醉酒驾驶，公安机关交通管理部门会约束至酒醒，吊销机动车驾驶证，依法追究刑事责任，并且五年内不得重新取得机动车驾驶证。在被查获后，驾驶人会被带到医院进行抽血检验，以确定血液中的酒精含量。之后会被依法刑事拘留。案件会进入刑事诉讼程序，经过侦查、审查起诉和审判等阶段。如果被法院判定有罪，将面临拘役并处罚金的刑事处罚。在刑事处罚执行完毕后，驾驶人在规定期限内不能重新考取驾驶证，且被扣留的摩托车需要按照交警部门的要求，在合适的时间前往指定地点办理相关手续领回。

酒后驾驶摩托车是严重的违法行为，不仅危害自己和他人的生命安全，还会面临严厉的法律制裁。为了自己和他人的安全，请严格遵守交通法规，杜绝酒后驾驶。

法律依据：

《道路交通安全违法行为处理程序规定》 第三十条

对扣留的车辆，当事人接受处理或者提供、补办的相关证明或者手续经核实后，公安机关交通管理部门应当依法及时退还。

公安机关交通管理部门核实的时间不得超过十日；需要延长的，经县级以上公安机关交通管理部门负责人批准，可以延长至十五日。核实时间自车辆驾驶人或者所有人、管理人提供被扣留车辆合法来历证明，补办相应手续，或者接受处理之日起计算。

发生道路交通事故因收集证据需要扣留车辆的，扣留车辆时间依照《道路交通事故处理程序规定》有关规定执行。