当股权转让评估价值低于净资产价时，需要分析评估价值低的原因，根据不同情况采取不同处理方式。可能需重新评估、与相关方协商调整转让价格，同时要确保交易符合法律法规和公司章程规定。

要明确评估价值低于净资产价可能存在多种原因。一方面可能是评估方法的选择不当。不同的评估方法，如市场法、收益法、成本法等，会得出不同的评估结果。如果采用的评估方法不适合被评估企业的实际情况，就可能导致评估价值偏低。例如，对于一些具有大量无形资产和未来收益潜力的企业，若仅采用成本法评估，可能无法充分体现企业的真实价值。另一方面，可能是评估过程中对企业资产和负债的认定不准确，遗漏了一些有价值的资产或者高估了负债。

如果发现评估价值低于净资产价，第一步可以考虑重新评估。可以聘请更有经验、资质更高的评估机构，采用更合适的评估方法对企业进行重新评估。在重新评估时，要确保评估机构全面了解企业的业务、资产和负债情况，提供准确、完整的财务资料和其他相关信息。

若重新评估后结果仍不理想，就需要与股权转让的相关方进行协商。对于转让方来说，可能希望提高转让价格以反映企业的真实价值；而受让方可能坚持以评估价值为基础进行交易。双方可以根据企业的实际情况，如未来发展前景、市场竞争力等，综合考虑确定一个合理的转让价格。

无论最终转让价格如何确定，都必须确保股权转让交易符合法律法规和公司章程的规定。根据《公司法》等相关法律，股权转让需要经过一定的程序，如股东会决议、签订转让协议、办理工商变更登记等。同时，公司章程可能对股权转让有特殊规定，如优先购买权等，也需要严格遵守。否则，可能会导致股权转让行为无效，引发法律纠纷。

在整个过程中，相关方还可以咨询专业的律师和财务顾问，以获取更专业的建议和指导，保障股权转让交易的顺利进行和各方的合法权益。

法律依据：

《中华人民共和国公司法》 第七十一条

有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。

股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。股东应就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意，其他股东自接到书面通知之日起满三十日未答复的，视为同意转让。其他股东半数以上不同意转让的，不同意的股东应当购买该转让的股权；不购买的，视为同意转让。

经股东同意转让的股权，在同等条件下，其他股东有优先购买权。两个以上股东主张行使优先购买权的，协商确定各自的购买比例；协商不成的，按照转让时各自的出资比例行使优先购买权。

公司章程对股权转让另有规定的，从其规定。