个人独资企业和有限公司的税率高低不能简单一概而论，二者在不同税种及不同情况下各有高低。个人独资企业没有企业所得税，缴纳个人所得税；有限公司需缴纳企业所得税，股东分红时还需缴纳个人所得税。

首先来分析个人独资企业的纳税情况。个人独资企业不缴纳企业所得税，而是缴纳个人所得税。其经营所得适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率。例如，若个人独资企业年应纳税所得额较低，可能适用较低的税率档次。以应纳税所得额为3万元为例，适用5%的税率，速算扣除数为0，那么应缴纳的个人所得税为30000×5% = 1500元。

接着看有限公司的纳税情况。有限公司需要缴纳企业所得税，一般企业的企业所得税税率为25%。但符合条件的小型微利企业，年应纳税所得额不超过100万元的部分，减按12.5%计入应纳税所得额，按20%的税率缴纳企业所得税；对年应纳税所得额超过100万元但不超过300万元的部分，减按50%计入应纳税所得额，按20%的税率缴纳企业所得税。当有限公司的股东进行分红时，还需要缴纳20%的个人所得税。假设一家有限公司年应纳税所得额为100万元，若不符合小型微利企业条件，需缴纳企业所得税100×25% = 25万元。若这100万元全部用于股东分红，股东还需缴纳个人所得税（100-25）×20% = 15万元，总共纳税40万元。

从流转税方面来看，个人独资企业和有限公司如果都属于小规模纳税人，在增值税征收上基本相同，征收率一般为3%（疫情期间有优惠政策）。如果是一般纳税人，二者适用的增值税税率也是根据不同的行业和业务来确定，并无本质区别。

综上所述，个人独资企业和有限公司的税率高低要综合多方面因素判断。在利润较低时，个人独资企业可能总体税负较低；而在利润较高且符合小型微利企业条件时，有限公司在企业所得税方面可能有一定优势，但加上分红的个人所得税后，整体税负情况需要具体计算分析。

法律依据：

《中华人民共和国企业所得税法》 第四条

企业所得税的税率为25％。

非居民企业取得本法第三条第三款规定的所得，适用税率为20％。

《中华人民共和国企业所得税法》 第五条

企业每一纳税年度的收入总额，减除不征税收入、免税收入、各项扣除以及允许弥补的以前年度亏损后的余额，为应纳税所得额。