回迁房两套是否在房管局算二套房，需根据具体情况判断。若回迁房已办理产权登记，通常会被计入名下房产套数，算二套房；若未办理产权登记，一般不算。

要明确房管局认定二套房的核心依据是房屋产权登记情况。在我国的房产管理体系中，房管局通过对产权登记信息的管理来确定个人名下的房产套数。

对于回迁房，如果这两套回迁房都已经完成了产权登记手续，也就是在房管局的系统中有了相应的产权记录，那么在房管局的认定里，就会将这两套回迁房都计入个人名下的房产套数。这种情况下，从房管局的统计口径来看，就算是拥有二套房了。例如，李先生有两套回迁房，并且都已经办理了房产证，那么当他再去房管局查询自己的房产情况时，就会显示名下有两套房产，后续如果他想要再购买其他房产，就会被认定为购买第三套房。

如果这两套回迁房还没有办理产权登记，虽然实际上已经回迁并居住，但在房管局的系统中并没有相关的产权信息记录。这种情况下，在房管局的统计中就不会将其算作名下的房产套数。比如，张女士有两套回迁房，但由于各种原因还未办理产权登记，当她去房管局查询自己名下房产套数时，可能显示为无房或者只有之前已经登记的其他房产。

在一些特殊地区，对于回迁房的认定政策可能会有所不同。有些地方可能会综合考虑回迁协议等相关材料来确定房产套数。所以，要准确判断回迁房两套是否算二套房，除了考虑产权登记情况外，还需要结合当地具体的房产政策来确定。

法律依据：

《住房和城乡建设部、中国人民银行、中国银行业监督管理委员会关于规范商业性个人住房贷款中第二套住房认定标准的通知》 第三条

有下列情形之一的，贷款人应对借款人执行第二套（及以上）差别化住房信贷政策：

（一）借款人首次申请利用贷款购买住房，如在拟购房所在地房屋登记信息系统（含预售合同登记备案系统，下同）中其家庭已登记有一套（及以上）成套住房的；

（二）借款人已利用贷款购买过一套（及以上）住房，又申请贷款购买住房的；

（三）贷款人通过查询征信记录、面测、面谈（必要时居访）等形式的尽责调查，确信借款人家庭已有一套（及以上）住房的。