当主债权超过申请执行期限时，债权人仍有多种维权途径。可以尝试与债务人协商，争取达成新的还款协议；也可收集债务人同意履行债务的证据，如书面承诺、还款计划等；还能通过提起诉讼，在诉讼中提出时效抗辩的应对策略。同时，要注意不同维权方式的法律规定和适用条件，以最大程度保障自身合法权益。
一、主债权超申请执行期限该咋维权
当主债权超过申请执行期限时，债权人并非完全失去维权途径。首先，债权人可以尝试与债务人进行协商。双方可以重新达成还款协议，在新的协议中约定还款的时间、方式等内容。根据法律规定，新的还款协议会形成新的债权债务关系，债权人可依据新协议要求债务人履行义务。
1、收集债务人同意履行的证据
如果债务人在超过执行期限后，有同意履行债务的表示，比如书面承诺还款、制定还款计划等，那么这些都可以作为新的证据。即使超过了原来的申请执行期限，债权人仍可凭借这些证据要求债务人还款。因为债务人同意履行债务会导致诉讼时效重新计算。
2、提起诉讼
债权人也可以向法院提起诉讼。虽然法院不会主动审查时效问题，但如果债务人在诉讼中提出时效抗辩，法院经审查认为确实超过时效的，可能会驳回债权人的诉讼请求。不过，债权人可以在诉讼中提出合理的理由和证据，证明存在时效中断、中止等情形，争取法院支持自己的诉求。
二、主债权超申请执行期限后协商还款的法律后果
主债权超申请执行期限后，与债务人协商还款具有重要的法律意义。当双方达成新的还款协议时，它会产生新的债权债务关系。这种新的关系是独立于原来超过执行期限的债权债务的。
1、新协议的效力
新的还款协议具有法律效力，双方都应当按照协议的约定履行各自的义务。如果债务人不履行新协议，债权人可以依据新协议向法院提起诉讼，要求债务人承担违约责任。
2、对时效的影响
新协议的达成会使诉讼时效重新计算。这意味着债权人又获得了一段新的时间来主张自己的权利。在新的诉讼时效期间内，债权人可以随时通过合法途径要求债务人还款。
三、主债权超申请执行期限提起诉讼的注意事项
主债权超申请执行期限后提起诉讼，有很多需要注意的地方。首先，要明确法院在审理案件时的态度。法院一般不会主动审查时效问题，只有当债务人提出时效抗辩时，法院才会进行审查。
1、时效抗辩的应对
如果债务人提出时效抗辩，债权人需要准备充分的证据和理由。比如，证明在原来的时效期间内存在时效中断、中止的情形。时效中断可能是因为债权人向债务人主张过权利、债务人同意履行义务等；时效中止可能是因为不可抗力等客观原因导致债权人无法行使权利。
2、证据的收集和整理
在诉讼过程中，证据至关重要。债权人要收集与债权债务相关的所有证据，如合同、借条、转账记录、聊天记录等。这些证据要能够清晰地证明债权债务的存在、履行情况以及双方的权利义务关系。
总之，主债权超过申请执行期限并不意味着债权人就失去了所有的权利。通过与债务人协商、收集证据、提起诉讼等方式，债权人仍有机会维护自己的合法权益。在实际操作中，要根据具体情况选择合适的维权方式。如果在维权过程中遇到复杂的法律问题，比如如何认定债务人同意履行债务的证据、如何应对债务人的时效抗辩等，都可以在本站免费问律师，我们的专业律师会为您提供详细的解答和专业的法律建议。
