北京商铺转让纠纷律师费的计算方式多样，主要包括按件收费、按标的额比例收费、计时收费、风险代理收费等，具体费用会因案件情况、律师资历等因素有所不同。

按件收费：对于一些争议相对较小、法律关系较为简单的商铺转让纠纷案件，律师可能会采用按件收费的方式。一般来说，这类案件的收费标准可能在几千元到数万元不等。例如，对于仅涉及简单的商铺交接手续问题，没有复杂的合同条款争议和较大金额赔偿的案件，收费可能在 5000 - 20000 元左右。律师会依据案件具体的复杂程度、耗费时间、工作量等因素来确定收费金额。

按标的额比例收费：当商铺转让纠纷涉及到较大的经济利益时，如涉及商铺转让费、违约金、赔偿金额等争议，通常会按照标的额的一定比例来收费。一般而言，标的额越大，收费比例相对越低。比如，标的额在 10 万元以下的部分，收费比例可能在 8% - 12%；10 万元至 100 万元的部分，收费比例可能在 5% - 7%；100 万元至 500 万元的部分，收费比例可能在 3% - 5%等。假设案件标的额为 50 万元，10 万元以下的部分收费 100000×10% = 10000 元，10 万元至 50 万元的部分收费(500000 - 100000)×6% = 24000 元，总共收费 10000 + 24000 = 34000 元。

计时收费：这种收费方式是根据律师为案件实际工作的时间来计算费用。律师的计时收费标准会因律师的经验、专业水平、知名度等因素而有所差异。在北京，普通律师的计时收费可能在每小时 200 - 500 元，而资深律师、知名律师的计时收费可能会达到每小时 1000 元以上。例如，律师为处理商铺转让纠纷案件总共工作了 20 小时，每小时收费 500 元，那么律师费就是 20×500 = 10000 元。

风险代理收费：在一些情况下，律师会与当事人约定风险代理收费。即律师前期不收取或只收取少量的基本费用，待案件胜诉或执行到位后，按照胜诉金额或执行到位金额的一定比例收取律师费。风险代理收费比例相对较高，一般不超过标的额的 30%。比如，案件胜诉后执行到位金额为 100 万元，约定的风险代理收费比例为 20%，则律师收取的律师费为 1000000×20% = 200000 元。此外，律师收费还会受到市场行情、案件的紧急程度等因素的影响。当事人在选择律师时，应与律师充分沟通，了解收费方式和标准，并签订详细的委托代理合同，以明确双方的权利和义务。

法律依据：

《律师服务收费管理办法》 第十九条

律师事务所在提供法律服务过程中代委托人支付的诉讼费、仲裁费、鉴定费、公证费和查档费，不属于律师服务费，由委托人另行支付。

第二十条

律师事务所需要预收异地办案差旅费的，应当向委托人提供费用概算，经协商一致，由双方签字确认。确需变更费用概算的，律师事务所必须事先征得委托人的书面同意。

《律师法》 第二十五条

律师承办业务，由律师事务所统一接受委托，与委托人签订书面委托合同，按照国家规定统一收取费用并如实入账。律师事务所和律师应当依法纳税。

第五十九条

律师收费办法，由国务院价格主管部门会同国务院司法行政部门制定。