变更公司章程流程主要包括提议、表决、编制文件、申请登记等步骤。

公司章程的变更需要经过一定的程序。第一步是提议。一般来说，有限责任公司董事会或执行董事可以提出修改公司章程的提议。在股份有限公司中，通常由董事会提出。这是因为董事会负责公司的日常经营管理，对公司的运营情况和发展需求有较为清晰的认识，能够判断是否需要对公司章程进行变更。

第二步是表决。对于有限责任公司，修改公司章程的决议必须经代表三分之二以上表决权的股东通过。而股份有限公司修改公司章程必须经出席股东大会的股东所持表决权的三分之二以上通过。这一规定确保了公司章程的变更能够得到大多数股东的认可，保障了公司决策的民主性和稳定性。

第三步是编制文件。公司需要编制股东会决议以及修改后的公司章程。股东会决议要明确记录关于公司章程变更的具体事项和表决结果等内容。修改后的公司章程要准确体现变更后的条款，并且要与股东会决议的内容相一致。

第四步是申请登记。公司需要携带股东会决议、修改后的公司章程以及其他相关材料，到公司登记机关申请变更登记。公司登记机关会对提交的材料进行审核，若材料符合要求，会对公司章程的变更进行登记备案。

此外，在整个变更过程中，还需要注意相关的通知和公告义务。例如，如果公司章程的变更涉及到公司的重大事项，可能需要通知债权人等相关利益方。并且，根据法律规定，公司还可能需要进行相应的公告，以保障公众的知情权。总之，变更公司章程需要严格按照法律规定的流程进行，以确保变更的合法性和有效性。

法律依据：

《中华人民共和国公司法》 第四十二条

股东会会议由股东按照出资比例行使表决权；但是，公司章程另有规定的除外。

《中华人民共和国公司法》 第四十三条

股东会的议事方式和表决程序，除本法有规定的外，由公司章程规定。

股东会会议作出修改公司章程、增加或者减少注册资本的决议，以及公司合并、分立、解散或者变更公司形式的决议，必须经代表三分之二以上表决权的股东通过。