已过诉讼时效的债权，抵押权并不必然消灭，但会受到法律限制。抵押权人行使抵押权可能会遇到障碍，抵押人可主张时效抗辩，法院通常不再保护抵押权人的权利。不过，抵押人自愿履行的除外。

根据法律规定，抵押权与其担保的债权同时存在，债权消灭的，抵押权也消灭。然而，对于已过诉讼时效的债权，法律有特殊的规定和处理方式。

诉讼时效对债权的影响：诉讼时效是指权利人在法定期间内不行使权利，就丧失请求人民法院依法保护其民事权利的法律制度。当债权的诉讼时效期间届满后，债权人虽然仍享有债权，但债务人获得了时效抗辩权。也就是说，如果债务人以诉讼时效已过为由进行抗辩，法院将不会强制其履行债务。

诉讼时效对抵押权的影响：在我国，抵押权的行使也受到诉讼时效的约束。根据《民法典》第四百一十九条规定，抵押权人应当在主债权诉讼时效期间行使抵押权；未行使的，人民法院不予保护。这意味着，当主债权诉讼时效届满后，抵押权人向法院请求行使抵押权，法院将不会支持其诉求。此时，抵押权虽然在理论上仍然存在，但实际上已无法通过司法途径实现。

抵押人的权利：当债权已过诉讼时效时，抵押人可以主张时效抗辩。即使抵押物仍然存在，抵押人也可以拒绝抵押权人实现抵押权的要求。这是为了平衡抵押权人和抵押人的利益，避免抵押权人长期怠于行使权利，而使抵押人的财产处于不确定状态。

特殊情况：如果抵押人自愿履行担保义务，比如主动配合抵押权人实现抵押权，那么这种履行是有效的，抵押人不能在履行后以诉讼时效已过为由要求返还。此外，虽然主债权已过诉讼时效，但如果抵押人与抵押权人就抵押权的实现达成新的协议，该协议也是有效的。

已过诉讼时效的债权抵押权虽然不会立即消灭，但在行使上会受到很大限制。抵押权人应当及时行使权利，以保障自身的合法权益。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第四百一十九条

抵押权人应当在主债权诉讼时效期间行使抵押权；未行使的，人民法院不予保护。

《中华人民共和国民法典》 第三百九十四条

为担保债务的履行，债务人或者第三人不转移财产的占有，将该财产抵押给债权人的，债务人不履行到期债务或者发生当事人约定的实现抵押权的情形，债权人有权就该财产优先受偿。

前款规定的债务人或者第三人为抵押人，债权人为抵押权人，提供担保的财产为抵押财产。