挪用公款逃跑3年后归还，仍会被追究刑事责任，但归还行为在量刑时会作为从轻处罚的情节予以考虑。具体的处理结果要依据挪用公款的数额、用途、情节等因素，按照相关法律规定来判定。

挪用公款的行为触犯了《中华人民共和国刑法》。根据法律规定，国家工作人员利用职务上的便利，挪用公款归个人使用，进行非法活动的，或者挪用公款数额较大、进行营利活动的，或者挪用公款数额较大、超过三个月未还的，是挪用公款罪。

即便挪用公款者在逃跑3年后归还了款项，也不能免除其刑事责任。不过，主动归还公款这一情节在司法实践中具有重要意义。它体现了行为人一定程度上的悔罪表现，避免或减少了公共财产的损失，法院在量刑时通常会将其作为从轻处罚的考量因素。

对于挪用公款罪的量刑，《刑法》规定，犯挪用公款罪的，处五年以下有期徒刑或者拘役；情节严重的，处五年以上有期徒刑。挪用公款数额巨大不退还的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑。这里的“不退还”，是指因客观原因在一审宣判前不能退还的。而逃跑3年后归还，不属于“不退还”的情形。

例如，若挪用公款数额较大用于营利活动，在归还后，若情节相对较轻，可能会在五年以下有期徒刑或者拘役的幅度内从轻处罚；若挪用公款进行非法活动且数额巨大，即便归还，也可能面临较重的刑罚，但相比不归还的情况，量刑会有所减轻。此外，司法机关在处理此类案件时，还会综合考虑挪用公款的时间长短、造成的社会影响等多方面因素，以确保作出公正合理的判决。

法律依据：

《最高人民法院关于审理挪用公款案件具体应用法律若干问题的解释》 第六条

携带挪用的公款潜逃的依照刑法第三百八十二条、第三百八十三条的规定定罪处罚。

《中华人民共和国刑法》 第三百八十二条

国家工作人员利用职务上的便利，侵吞、窃取、骗取或者以其他手段非法占有公共财物的，是贪污罪。受国家机关、国有公司、企业、事业单位、人民团体委托管理、经营国有财产的人员，利用职务上的便利，侵吞、窃取、骗取或者以其他手段非法占有国有财物的，以贪污论。