小产权房产证和大产权房产证主要在合法性、产权归属、交易和转让限制、土地性质等方面存在区别。

合法性方面，大产权房产证是合法合规的，是由国家相关部门颁发的。在建造时，该房产项目经过了合法的立项、规划、土地出让等一系列正规程序，受到法律的保护。而小产权房产证并不具备合法性，它没有经过国家相关部门的审批，也未缴纳土地出让金等费用，是在集体土地上建设的房屋所颁发的“证件”，实际上并非真正意义的房产证。

产权归属方面，拥有大产权房产证的房屋，购房者对房屋拥有完整的产权，包括房屋所有权和对应的土地使用权。可以自由地对房屋进行占有、使用、收益和处分。而小产权房的产权归属较为复杂，其土地所有权一般归集体所有，购房者只拥有房屋的使用权，并不拥有土地的使用权。

交易和转让限制方面，大产权房可以在市场上自由交易和转让，不受过多限制，买卖双方只需按照规定办理相关的过户手续即可。而小产权房由于其不合法性，通常不能在市场上自由流通和转让。即便进行私下交易，也无法办理合法的过户手续，权益难以得到保障。

土地性质方面，大产权房所占用的土地是通过合法的出让方式获得的国有土地，具有明确的土地使用年限。而小产权房是建在集体土地上，如农村宅基地、集体建设用地等，土地性质决定了其产权的特殊性和交易的局限性。

在面临拆迁补偿时，大产权房的业主能依法获得合理的补偿。而小产权房由于不合法，在拆迁时可能无法获得补偿，或者补偿标准较低。综上所述，小产权房产证和大产权房产证存在显著区别，在购房时应谨慎选择。

法律依据：

《中华人民共和国刑事诉讼法》 第九十一条

公安机关对被拘留的人，认为需要逮捕的，应当在拘留后的三日以内，提请人民检察院审查批准。在特殊情况下，提请审查批准的时间可以延长一日至四日。对于流窜作案、多次作案、结伙作案的重大嫌疑分子，提请审查批准的时间可以延长至三十日。人民检察院应当自接到公安机关提请批准逮捕书后的七日以内，作出批准逮捕或者不批准逮捕的决定。人民检察院不批准逮捕的，公安机关应当在接到通知后立即释放，并且将执行情况及时通知人民检察院。对于需要继续侦查，并且符合取保候审、监视居住条件的，依法取保候审或者监视居住。