孕妇起诉离婚时，孩子尚未出生，一般在孩子出生后，两周岁以内原则上归母亲抚养，但也存在特殊情况会导致抚养权归属发生变化。

在法律规定中，对于子女抚养权的判定遵循有利于子女身心健康、保障子女合法权益的原则。当孕妇起诉离婚时，孩子还未出生，不存在抚养权的立即判定问题。通常情况下，孩子出生后，如果双方就抚养权问题无法达成一致而诉至法院，两周岁以内的子女，以由母亲直接抚养为原则。这是因为这个阶段的孩子对母亲的生理和情感需求更为依赖，母亲在照顾孩子方面往往更具优势，更有利于孩子的成长。

不过，也存在一些特殊情形，可能导致孩子的抚养权不判给母亲。例如，母亲患有久治不愈的传染性疾病或者其他严重疾病，子女不宜与其共同生活；母亲有抚养条件却不尽抚养义务，而父亲要求子女随其生活；因其他原因，子女确不宜随母亲生活等。在这些情况下，法院可能会综合考虑各种因素，将抚养权判给父亲。

如果父母双方协议两周岁以下子女由父亲直接抚养，并对子女健康成长无不利影响的，人民法院也会予以支持。在确定抚养权归属时，法院还会考虑父母双方的抚养能力和抚养条件等具体情况。抚养能力包括经济收入、住房条件、教育背景等方面；抚养条件则涉及家庭环境、与孩子的感情基础等因素。

孕妇起诉离婚后孩子的抚养权归属需要综合多方面因素来确定，最终目的是为了保障孩子能够在一个稳定、健康的环境中成长。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第一千零八十四条

父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。

离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。

离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。