夫妻因感情不和离婚时，两个孩子的抚养权归属需综合多方面因素判断。一般情况下，法院会倾向于一方抚养一个孩子，但也会根据具体情况将两个孩子的抚养权判给同一方。

在司法实践中，对于夫妻离婚时两个孩子抚养权的判定，遵循的基本原则是保障子女的利益最大化。会考虑孩子的年龄。根据法律规定，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。这是因为这个阶段的孩子对母亲的依赖度较高，母亲的照顾通常更有利于孩子的成长和发育。例如，孩子尚在哺乳期，母亲能够给予更贴心的照料。

已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。法院会综合考量双方的抚养能力和抚养条件，如双方的经济收入、居住环境、工作稳定性等。经济条件较好、居住环境更适宜孩子成长的一方，在争取抚养权时可能更具优势。同时，还会考虑双方的品德、教育背景等因素，品德良好、有正确教育观念的一方更有利于孩子的身心健康发展。

如果子女已满八周岁，应当尊重其真实意愿。此时孩子已经有了一定的认知和判断能力，他们的想法在抚养权判定中会被充分考虑。比如，孩子明确表示愿意跟随某一方生活，法院通常会予以重视。

如果一方存在不适合抚养孩子的情形，如患有严重疾病、有不良嗜好（赌博、吸毒等）、存在虐待孩子等行为，法院可能会将两个孩子的抚养权都判给另一方。法院在判决两个孩子抚养权归属时，会全面、综合地考虑各种因素，以确保孩子能够在一个健康、稳定的环境中成长。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第一千零八十四条

父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。

离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。

离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。