公司账目不清楚时，股东可以通过查阅公司财务资料、要求审计、向相关部门举报、通过诉讼等方式来维护自身权益。

当公司账目不清楚时，股东有多种途径来解决问题。股东享有查阅权。根据《公司法》规定，股东有权查阅、复制公司章程、股东会会议记录、董事会会议决议、监事会会议决议和财务会计报告。股东可以书面请求查阅公司会计账簿。公司有合理根据认为股东查阅会计账簿有不正当目的，可能损害公司合法利益的，可以拒绝提供查阅，并应当自股东提出书面请求之日起十五日内书面答复股东并说明理由。公司拒绝提供查阅的，股东可以请求人民法院要求公司提供查阅。这是股东了解公司真实财务状况的重要手段。

股东可以提议对公司进行审计。如果股东怀疑公司账目存在问题，可以提议召开股东会，由股东会决定聘请专业的审计机构对公司的财务状况进行审计。审计机构会依据专业的审计准则和方法，对公司的账目进行全面审查，以确定是否存在问题。

若股东发现公司账目存在违法违规行为，如偷税漏税、财务造假等，可以向相关部门进行举报。例如，向税务部门举报偷税漏税行为，向证券监管部门举报上市公司的财务造假等。相关部门会对举报进行调查处理，维护市场秩序和股东的合法权益。

当其他途径无法解决问题时，股东可以通过诉讼的方式来维护自己的权益。股东可以以公司为被告，向法院提起诉讼，要求公司提供真实、准确的账目信息，或者要求对公司进行清算等。在诉讼过程中，股东需要提供相关的证据来支持自己的主张。股东在面对公司账目不清楚的情况时，要善于运用法律赋予的权利，采取合适的措施来维护自身的合法权益。

法律依据：

《中华人民共和国公司法》 第三十三条

股东有权查阅、复制公司章程、股东会会议记录、董事会会议决议、监事会会议决议和财务会计报告。

股东可以要求查阅公司会计账簿。股东要求查阅公司会计账簿的，应当向公司提出书面请求，说明目的。公司有合理根据认为股东查阅会计账簿有不正当目的，可能损害公司合法利益的，可以拒绝提供查阅，并应当自股东提出书面请求之日起十五日内书面答复股东并说明理由。公司拒绝提供查阅的，股东可以请求人民法院要求公司提供查阅。