如果检察院起诉案子超过法定期限，需根据不同情况处理。若因不可抗力等正当理由导致超期，可申请延长或重新计算期限；若属于无正当理由超期，可能存在程序违法问题，犯罪嫌疑人及其辩护人可提出异议，要求依法处理，甚至可能导致证据无效、起诉被驳回等结果。

在刑事诉讼中，检察院起诉案子有严格的时间限制，这是保障司法公正和效率、维护当事人合法权益的重要规定。

要明确超期的原因。若存在不可抗力、关键证据需补充侦查且符合法定程序等正当理由，根据法律规定，检察院可以依法申请延长审查起诉期限或者重新计算审查起诉期限。例如，遇到重大自然灾害等不可抗力事件，导致案件相关工作无法正常开展，在这种情况下，经法定程序批准，期限可作相应调整。

如果是无正当理由超期，这就涉及程序违法问题。对于犯罪嫌疑人及其辩护人而言，他们有权向检察院提出异议。这种异议可以通过书面或口头的方式提出，要求检察院说明超期的原因并依法处理。从法律后果来看，程序违法可能带来多方面的影响。一方面，可能导致某些证据因超期取得而被认定为无效。比如，在超期的情况下收集的证人证言，可能会因为违反法定程序而不被法庭采纳。另一方面，如果超期情况严重，可能会导致起诉被驳回。法院在审理案件时，对于检察院违反法定程序超期起诉的情况，有权根据法律规定作出驳回起诉的裁定。

对于这种程序违法问题，相关的司法监督机制也会发挥作用。上级检察院可以对下级检察院的超期起诉行为进行监督和纠正，以确保司法程序的合法性和公正性。同时，当事人也可以通过合法途径，如向检察院的纪检监察部门反映情况等，来维护自己的合法权益。检察院起诉案子过期需要根据具体情况依法妥善处理，以保障司法的公正和当事人的合法权益。

法律依据：

《律师服务收费管理办法》 第十九条

律师事务所在提供法律服务过程中代委托人支付的诉讼费、仲裁费、鉴定费、公证费和查档费，不属于律师服务费，由委托人另行支付。

第二十条

律师事务所需要预收异地办案差旅费的，应当向委托人提供费用概算，经协商一致，由双方签字确认。确需变更费用概算的，律师事务所必须事先征得委托人的书面同意。

《律师法》 第二十五条

律师承办业务，由律师事务所统一接受委托，与委托人签订书面委托合同，按照国家规定统一收取费用并如实入账。律师事务所和律师应当依法纳税。

第五十九条

律师收费办法，由国务院价格主管部门会同国务院司法行政部门制定。