当肇事者不愿意垫付医药费时，可以通过自行垫付保留票据、申请交强险垫付、申请道路交通事故社会救助基金、协商解决、申请调解以及向法院起诉等方式处理。

在交通事故发生后，若肇事者不愿意垫付医药费，以下是一些可行的处理办法。

伤者一方应自行垫付医药费，并注意保留好相关的票据和病历等资料。这是因为后续无论是与肇事者协商赔偿，还是通过法律途径解决纠纷，这些材料都是重要的证据，能证明实际的医疗支出情况。

可以申请交强险垫付。根据相关规定，在被保险机动车发生道路交通事故造成本车人员、被保险人以外的受害人人身伤亡、财产损失的，由保险公司依法在机动车交通事故责任强制保险责任限额范围内予以赔偿。在满足一定条件下，如驾驶人未取得驾驶资格或者醉酒、被保险机动车被盗抢期间肇事、被保险人故意制造道路交通事故等情况之外，保险公司会在交强险责任限额内垫付抢救费用。

还能申请道路交通事故社会救助基金。道路交通事故社会救助基金是用于垫付机动车道路交通事故中受害人人身伤亡的丧葬费用、部分或者全部抢救费用的社会专项基金。符合条件的情况下，救助基金管理机构会垫付相关费用。

与肇事者及其保险公司进行协商也是一种方式。可以尝试与对方沟通，说明伤者的实际情况和困难，争取让对方垫付或者配合后续的理赔工作。若协商不成，可以申请公安机关交通管理部门进行调解。公安机关交通管理部门会根据事故情况，组织双方进行调解，促使达成赔偿协议。

如果上述方法都无法解决问题，那么可以向法院提起诉讼。通过法律途径要求肇事者承担赔偿责任，法院会根据事故责任认定和相关证据，判决肇事者赔偿相应的医药费及其他损失。在诉讼过程中，要注意收集和整理好各项证据，以维护自己的合法权益。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第一千一百七十九条

侵害他人造成人身损害的，应当赔偿医疗费、护理费、交通费、营养费、住院伙食补助费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入。造成残疾的，还应当赔偿辅助器具费和残疾赔偿金；造成死亡的，还应当赔偿丧葬费和死亡赔偿金。