怀孕期间离婚，孩子出生后抚养权一般会判给母亲。但也存在特殊情况，法院会根据具体情形综合判断以确定抚养权归属。

在法律层面，对于怀孕期间离婚后孩子抚养权的判决，有明确的规定和考量因素。

通常情况下，两周岁以内的子女，以由母亲直接抚养为原则。因为这个阶段的孩子对母亲的生理和情感依赖更为强烈，母亲在喂养、照顾等方面具有天然的优势，能够更好地满足孩子成长的需求。所以怀孕期离婚，等孩子出生后，大概率抚养权会判给母亲。

不过，也存在一些特殊情形，可能导致抚养权不判给母亲。如果母亲存在一些不利于孩子成长的情况，法院可能会将抚养权判给父亲。例如，母亲患有久治不愈的传染性疾病或者其他严重疾病，子女不宜与其共同生活；母亲有抚养条件却不尽抚养义务，而父亲要求子女随其生活；因其他原因，子女确不宜随母亲生活的。

法院在判决抚养权归属时，始终以最有利于未成年子女的原则为出发点。会综合考虑父母双方的抚养能力和抚养条件等因素。抚养能力包括经济收入、居住条件、教育背景等，抚养条件则涉及父母的品德、生活习惯等方面。比如，父亲具有更好的经济条件，能够为孩子提供更优质的生活和教育资源，同时母亲存在不良的生活习惯，如酗酒、赌博等，这些情况都会影响法院的判决。

如果父母双方能够就孩子抚养权问题达成协议，且该协议不损害孩子的合法权益，法院一般也会尊重双方的意愿。

怀孕期离婚孩子抚养权的判决并非绝对，法院会结合各种实际情况，确保孩子能够在一个健康、稳定的环境中成长。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第一千零八十四条

父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。

第一千零八十五条

离婚后，子女由一方直接抚养的，另一方应当负担部分或者全部抚养费。负担费用的多少和期限的长短，由双方协议；协议不成的，由人民法院判决。