借款协议本身一般是长期有效的，只要协议是依法成立的，自成立时就生效，对当事人具有法律约束力。但如果涉及到借款协议纠纷的诉讼时效，一般是三年。

根据《中华人民共和国民法典》第四百六十九条规定，当事人订立合同，可以采用书面形式、口头形式或者其他形式。书面形式是合同书、信件、电报、电传、传真等可以有形地表现所载内容的形式。以电子数据交换、电子邮件等方式能够有形地表现所载内容，并可以随时调取查用的数据电文，视为书面形式。依法成立的借款协议，自成立时生效，除非当事人另有约定或者法律、行政法规另有规定。这意味着，一旦借款协议符合法律规定的生效要件，它就会一直有效，对双方当事人产生法律约束力。

当出现借款纠纷，需要通过法律途径解决时，就涉及到诉讼时效的问题。根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。

在借款协议中，如果约定了还款期限，那么诉讼时效从还款期限届满之日起计算三年。如果没有约定还款期限，那么出借人可以随时要求借款人还款，但要给借款人合理的准备时间。在这种情况下，诉讼时效从出借人要求借款人还款的宽限期届满之日起计算三年。不过，如果出借人在借款后二十年内都没有主张权利，那么法院将不再保护其权利。

诉讼时效还可能会因为一些法定事由而中断、中止。例如，权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务、权利人提起诉讼或者申请仲裁等，都会导致诉讼时效中断，从中断时起，诉讼时效期间重新计算。而在诉讼时效期间的最后六个月内，因不可抗力等法定障碍，不能行使请求权的，诉讼时效中止，自中止时效的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间届满。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第一百四十三条

具备下列条件的民事法律行为有效：

（一）行为人具有相应的民事行为能力；

（二）意思表示真实；

（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。

《中华人民共和国民法典》 第六百六十七条

借款合同是借款人向贷款人借款，到期返还借款并支付利息的合同。

《中华人民共和国民法典》 第六百六十八条

借款合同应当采用书面形式，但是自然人之间借款另有约定的除外。借款合同的内容一般包括借款种类、币种、用途、数额、利率、期限和还款方式等条款。