开发商房产证逾期超过三年不能起诉，因为向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。不过诉讼时效存在中止、中断的情况，若出现法定情形，诉讼时效会重新计算。

在法律层面，根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。这意味着从开发商逾期办理房产证的违约行为发生之日起，如果三年内购房者没有通过合法途径主张权利，比如提起诉讼、向开发商书面催告等，那么在三年期满后，开发商可能会以诉讼时效已过进行抗辩。一旦开发商的这种抗辩成立，购房者将面临败诉的风险，即可能无法通过法院的判决强制开发商承担逾期办理房产证的违约责任。

诉讼时效并非是一成不变持续计算的。该法典第一百九十五条规定了诉讼时效中断的情形。例如，购房者在诉讼时效期间内，向开发商发送书面函件要求其尽快办理房产证，或者通过电话、短信等方式明确表达要求开发商承担违约责任的意愿，那么诉讼时效就会中断。从中断时起，诉讼时效期间重新计算。

第一百九十四条规定了诉讼时效中止的情形。在诉讼时效期间的最后六个月内，如果因不可抗力、无民事行为能力人或者限制民事行为能力人没有法定代理人等障碍，不能行使请求权的，诉讼时效中止。自中止时效的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间届满。

所以，虽然一般情况下开发商房产证逾期三年后起诉存在败诉风险，但由于存在诉讼时效中断、中止等法定情形，购房者仍有可能在三年后通过合理的举证和法律依据来维护自己的合法权益。购房者在遇到开发商逾期办理房产证的情况时，应及时采取措施，避免错过主张权利的最佳时机。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第一百八十八条

向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。