一方不愿意离婚，另一方可以通过诉讼离婚的方式来解除婚姻关系。分居五六年可作为感情破裂的证据，有助于法院判决离婚。

在婚姻关系中，当一方不愿意离婚，而另一方坚持要结束婚姻时，诉讼离婚是可行的途径。根据我国法律规定，夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。

对于分居五六年这种情况，《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条规定，因感情不和分居满二年，调解无效的，应当准予离婚。这里需要强调的是，必须是因感情不和而分居，而不是因为工作、学习等其他原因分居。因此，主张离婚的一方需要收集相关证据来证明分居的事实以及分居是因感情不和导致的。

证据收集方面，可以有多种方式。比如，在外租房的租赁合同，能证明一方在一定时间内居住在别处；分居期间双方的聊天记录、书信等，如果其中有涉及感情不和以及分居情况的内容，也可以作为证据；居委会、物业等开具的居住证明，或者邻居的证人证言等，都可能对证明分居事实起到作用。

向法院提起离婚诉讼时，要向有管辖权的法院提交起诉状和相关证据。起诉状应当记明原告和被告的基本信息、诉讼请求和所根据的事实与理由、证据和证据来源，证人姓名和住所等事项。法院在受理案件后，一般会先进行调解。调解贯穿于离婚诉讼的全过程，如果调解无效，法院会根据双方提供的证据和庭审情况进行判决。

由于分居五六年的时间较长，如果能充分证明是因感情不和分居，那么法院在审理时，很大程度上会认定夫妻感情确已破裂，从而判决准予离婚。不过，具体的判决结果还需结合案件的实际情况和证据的充分性来确定。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第一千零七十九条

夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。

人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。

有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：

（一）重婚或者与他人同居；

（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；

（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；

（四）因感情不和分居满二年；

（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。

一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。