申请软件著作权证件，需准备相关材料，然后通过网上填写申请表、提交材料、缴纳费用等步骤，经版权保护中心审核，审核通过后即可获得证件。

要明确申请软件著作权所需的材料。主要包括软件的鉴别材料，这分为程序和文档的鉴别材料。程序和文档的鉴别材料应当由源程序和任何一种文档前、后各连续30页组成。整个程序和文档不到60页的，应当提交整个源程序和文档。同时，还要准备好申请人的身份证明，如个人申请需提供身份证复印件，企业申请需提供营业执照副本复印件等。还有其他可能需要的证明文件，例如有著作权归属书面合同或者项目任务书的，应当提交合同或者项目任务书。

申请流程。第一步是进行网上填写申请表。登录中国版权保护中心网站，进行用户注册，然后按照要求填写软件著作权登记申请表。填写内容包括软件基本信息、开发情况、权利状况等。确保填写的信息准确无误，因为这将直接影响到后续的审核。

第二步是提交材料。将准备好的申请材料邮寄或直接递交到中国版权保护中心。版权保护中心收到申请材料后，会对材料进行初步审查。如果材料不齐全或不符合要求，会通知申请人补正。

第三步是缴纳费用。根据规定的收费标准缴纳软件著作权登记费用。缴费方式可以通过银行汇款等方式进行。只有缴纳费用后，申请才会进入正式的审核流程。

版权保护中心会对申请进行实质审核。审核时间一般为受理之日起60个工作日。如果审核通过，版权保护中心会颁发软件著作权登记证书；如果审核不通过，会说明理由，申请人可以根据情况进行修改后再次申请。

法律依据：

《计算机软件著作权登记办法》 第二十条

中国版权保护中心应当自受理日起60日内审查完成所受理的申请，申请符合《条例》和本办法规定的，予以登记，发给相应的登记证书，并予以公告。