协议离婚时，子女抚养费的合理计算需综合考虑子女实际需要、父母双方负担能力和当地实际生活水平，一般可按固定收入一定比例给付，也可依当年总收入等确定，特殊情况可适当调整。

在协议离婚中，合理计算子女抚养费是保障子女健康成长的重要环节。子女抚养费的计算有一定的参考标准。根据相关法律和司法实践，有固定收入的，抚育费一般可按其月总收入的百分之二十至三十的比例给付。负担两个以上子女抚育费的，比例可适当提高，但一般不得超过月总收入的百分之五十。例如，一方月收入为10000元，那么一个子女的抚养费每月大概在2000-3000元较为合理；若有两个子女，抚养费可能在3000-5000元之间。

对于无固定收入的情况，抚育费的数额可依据当年总收入或同行业平均收入，参照上述比例确定。比如从事个体经营的一方，难以确定每月固定收入，就可以根据当地同行业的平均收入来计算抚养费。

在某些特殊情况下，抚养费的比例可以适当提高或降低。如果子女患有重大疾病需要高额医疗费用，或者有其他特殊需求，可适当提高抚养费比例。相反，如果一方收入明显降低，或者存在其他特殊困难，也可以适当降低抚养费的给付标准。

在计算抚养费时，还需要考虑当地的实际生活水平。不同地区的生活成本差异较大，在经济发达地区，子女的教育、生活等费用相对较高，抚养费的数额也应相应提高；而在经济相对落后的地区，抚养费数额则可适当降低。同时，抚养费应包括子女的生活费、教育费、医疗费等必要费用。

协议离婚时计算子女抚养费要全面考虑各种因素，以保障子女的合法权益和健康成长，同时也要结合父母双方的实际情况，确保抚养费的计算合理、公平。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第一千零八十五条

离婚后，子女由一方直接抚养的，另一方应当负担部分或者全部抚养费。负担费用的多少和期限的长短，由双方协议；协议不成的，由人民法院判决。

前款规定的协议或者判决，不妨碍子女在必要时向父母任何一方提出超过协议或者判决原定数额的合理要求。