车位购买协议丢失可通过联系开发商或卖方、查询备案记录、登报声明等方式处理，之后与相关方协商补签协议。

可以尝试联系开发商或卖方。因为开发商或卖方通常会保留一份车位购买协议的原件或副本。向他们说明协议丢失的情况，请求查看并复印他们留存的协议。一般情况下，正规的开发商或卖方会配合提供相关材料。

其次，查询备案记录。如果车位购买协议在相关部门进行了备案，如房地产管理部门等，可以携带本人有效身份证件前往备案部门申请查询备案信息。备案信息通常会详细记录车位的相关情况以及购买协议的主要内容，这些查询到的信息可以作为协议丢失后的重要参考。

再者，登报声明。为了避免协议被他人冒用带来不必要的风险，可以在当地有影响力的报纸上刊登协议丢失的声明。声明中应包含车位的具体信息、购买人的基本信息等内容，以证明原协议已丢失，自声明发布后，若出现他人冒用原协议产生的问题，自己可免责。

最后，协商补签协议。在获取了相关的协议信息或完成登报声明后，与开发商或卖方协商补签车位购买协议。补签的协议内容应与原协议一致，明确双方的权利和义务，包括车位的位置、面积、价格、交付时间等重要条款。在补签协议时，要确保协议的合法性和有效性，必要时可以咨询专业律师的意见。

总之，车位购买协议丢失后不必过于惊慌，按照上述步骤处理，能够最大程度地保障自身的合法权益。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第五百九十五条

买卖合同是出卖人转移标的物的所有权于买受人，买受人支付价款的合同。

《中华人民共和国民法典》 第五百九十六条

买卖合同的内容一般包括标的物的名称、数量、质量、价款、履行期限、履行地点和方式、包装方式、检验标准和方法、结算方式、合同使用的文字及其效力等条款。