分居离婚起诉时，能证明分居的材料有分居协议、房屋租赁合同、居委会证明、证人证言、聊天记录、邮件记录等。

在通过起诉方式以分居为由离婚时，证明分居是重要的环节，以下是一些常见能证明分居的材料。

分居协议：夫妻双方签订的分居协议是最直接的证明材料。协议中会明确约定分居的起始时间、地点等关键信息，这具有较强的证明力。如果双方在分居时就通过书面协议对分居事宜进行了明确，那么在法庭上，该协议是有力的分居证据。

房屋租赁合同：一方在外租房居住的合同能证明其居住地点与另一方分开。合同上会有租赁的起始日期、房屋地址等内容，可以清晰地表明从何时起开始单独居住。并且，支付租金的记录如转账截图、发票等，也可作为辅助证据，进一步证明分居事实。

居委会证明：居委会作为基层组织，对居民的居住情况有一定了解。可以请求居委会出具证明，说明一方在某段时间内单独居住在其辖区内的具体地址。居委会的证明具有一定的公信力，在法庭上有较高的证明效力。

证人证言：与双方都比较熟悉且了解分居情况的人，如双方的朋友、邻居等，他们的证人证言可以从侧面证明分居事实。不过证人需要出庭作证，并接受双方当事人和法庭的询问。

聊天记录、邮件记录：夫妻双方在交流过程中，如果有涉及到分居内容的聊天记录或邮件，也可以作为证据。这些记录可以反映出双方分居的意愿和实际的分居状态。但要注意，此类证据要确保其真实性和完整性。此外，双方之间的通话录音，如果能清晰显示出分居的相关信息，同样可以起到证明作用。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第一千零七十九条

夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。

人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。

有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：

（一）重婚或者与他人同居；

（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；

（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；

（四）因感情不和分居满二年；

（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。

一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。