分居两年向法院起诉离婚，法院会根据具体情况进行判决。若能认定因感情不和分居满两年，且调解无效，一般会判决准予离婚；若不能认定这一法定情形，或一方有证据证明夫妻感情未破裂，法院可能判决不准离婚。

在我国，离婚有协议离婚和诉讼离婚两种方式。当夫妻一方选择通过诉讼方式，以分居两年为由向法院提起离婚诉讼时，法院会遵循一定的规则和标准来作出判决。

法院会审查分居的原因。法律规定的准予离婚的分居情形是“因感情不和分居满两年”。也就是说，必须是因为夫妻双方感情出现问题，无法共同生活而分居。如果是因为工作、学习等客观原因导致的分居，即使分居时间满两年，也不符合法定离婚条件。例如，一方被单位派往外地工作两年，这种分居并非基于感情不和，法院一般不会据此认定可以判决离婚。

其次，关于分居时间的计算。必须是连续的、不间断的满两年。在这两年期间，如果夫妻双方有过共同生活的情况，分居时间可能会重新计算。而且，当事人需要提供证据证明分居的起始和结束时间，比如租房合同、居委会证明、证人证言等。

再者，即使满足因感情不和分居满两年的条件，法院也不会直接判决离婚。根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条规定，人民法院审理离婚案件，应当进行调解。调解是离婚诉讼的必经程序，只有在调解无效的情况下，法院才会根据夫妻感情是否确已破裂来判决是否准予离婚。

最后，如果另一方有证据证明夫妻感情尚未破裂，比如双方仍有沟通、互相关心等情况，法院也可能会判决不准离婚。总之，法院判决离婚是以夫妻感情是否确已破裂为核心标准，分居两年只是其中一个可以参考的法定情形。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第一千零七十九条

夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。

人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。

有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：

（一）重婚或者与他人同居；

（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；

（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；

（四）因感情不和分居满二年；

（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。

一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。